More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4679 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  59.35 
 
 
596 aa  700    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4679  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
592 aa  1229    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2460  monooxygenase FAD-binding  56.01 
 
 
595 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6470  monooxygenase, FAD-binding  47.41 
 
 
586 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.71496  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4564  monooxygenase FAD-binding  44.58 
 
 
598 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.669744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4406  monooxygenase, FAD-binding  44.48 
 
 
597 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.814419  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5534  monooxygenase FAD-binding  43.59 
 
 
584 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.105639  hitchhiker  0.00000473423 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6462  monooxygenase, FAD-binding  46.82 
 
 
598 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1463  monooxygenase FAD-binding  43.52 
 
 
598 aa  477  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7439  2,4-dichlorophenol hydroxylase  43.32 
 
 
585 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2298  monooxygenase, FAD-binding  44.52 
 
 
580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0352446  hitchhiker  0.0088842 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1929  monooxygenase, FAD-binding  43.11 
 
 
619 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3045  monooxygenase, FAD-binding  42.44 
 
 
600 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000523244  unclonable  0.000000929922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0899  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 
586 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.67308e-16  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09029  FAD dependent oxidoreductase, putative (JCVI)  39.29 
 
 
579 aa  404  1e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05044  conserved hypothetical protein  37.96 
 
 
619 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.163159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2986  monooxygenase FAD-binding  37.31 
 
 
611 aa  345  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06130  conserved hypothetical protein  38.68 
 
 
522 aa  303  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442853  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2185  monooxygenase, FAD-binding  36.62 
 
 
590 aa  297  4e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245304  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4588  monooxygenase FAD-binding  33.06 
 
 
555 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4156  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  32.7 
 
 
541 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  0.0299299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29830  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  30.97 
 
 
543 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.832343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3504  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.88 
 
 
539 aa  241  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3518  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.81 
 
 
539 aa  239  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3219  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  29.3 
 
 
545 aa  238  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3526  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  30.29 
 
 
539 aa  237  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1744  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  29.54 
 
 
539 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.572505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  30.84 
 
 
524 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3271  PheA/TfdB family polyketide hydroxylase  29.13 
 
 
544 aa  232  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.654558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4181  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  30.32 
 
 
531 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895625  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3220  monooxygenase FAD-binding  29.49 
 
 
539 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0848  hypothetical protein  30.62 
 
 
511 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.970878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3564  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.96 
 
 
539 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.89711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3304  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.96 
 
 
544 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3520  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  28.96 
 
 
539 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0131  2,4-dichlorophenol 6-monooxygenase  32.14 
 
 
556 aa  225  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0320392  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1083  monooxygenase FAD-binding  31.47 
 
 
523 aa  216  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213511  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3894  monooxygenase FAD-binding  32.15 
 
 
540 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0436183  normal  0.0134982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6338  monooxygenase FAD-binding  30.21 
 
 
504 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  30.77 
 
 
543 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  30.1 
 
 
554 aa  193  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3769  hypothetical protein  29.17 
 
 
564 aa  193  8e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6165  monooxygenase FAD-binding protein  30.1 
 
 
520 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4076  hypothetical protein  30.33 
 
 
578 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165251  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87314  predicted protein  29.56 
 
 
606 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.002805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2389  hypothetical protein  27.9 
 
 
557 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4892  hypothetical protein  27.24 
 
 
564 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0498261  normal  0.117948 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08410  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  28.25 
 
 
624 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7059  monooxygenase FAD-binding  28.16 
 
 
512 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.120859  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0451  hypothetical protein  30.73 
 
 
617 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4124  hypothetical protein  28.25 
 
 
559 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000171711  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2333  monooxygenase FAD-binding  26.23 
 
 
536 aa  167  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.307173 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5061  hypothetical protein  27.9 
 
 
562 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2690  monooxygenase FAD-binding protein  28.02 
 
 
519 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0584184 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07415  conserved hypothetical protein  27.77 
 
 
524 aa  147  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.300913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  30.81 
 
 
388 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  31.57 
 
 
511 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  33.77 
 
 
506 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2129  monooxygenase FAD-binding protein  27.84 
 
 
543 aa  137  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4304  monooxygenase, FAD-binding  30.49 
 
 
520 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.11 
 
 
968 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  33.42 
 
 
498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  32.7 
 
 
529 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  32.34 
 
 
553 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6800  monooxygenase FAD-binding  31.46 
 
 
518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  32.34 
 
 
475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2329  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  27.17 
 
 
622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5086  monooxygenase, FAD-binding  27.7 
 
 
570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  30.18 
 
 
547 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5774  monooxygenase, FAD-binding  27.7 
 
 
570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.750601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  32.47 
 
 
546 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  32.34 
 
 
493 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  32.12 
 
 
537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  32.75 
 
 
478 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5321  FAD-dependent oxidoreductase  29.87 
 
 
561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124532  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  32.23 
 
 
503 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  29.82 
 
 
486 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  32.54 
 
 
478 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  32.54 
 
 
478 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4404  monooxygenase FAD-binding  29.87 
 
 
565 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984317  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  31.58 
 
 
477 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.81 
 
 
505 aa  126  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0378  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.34 
 
 
554 aa  126  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0214512  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5805  monooxygenase FAD-binding  29.79 
 
 
547 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000018754  hitchhiker  0.00132409 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0411  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.61 
 
 
554 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0836277  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4535  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  29.89 
 
 
615 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0371  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.61 
 
 
554 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  30.15 
 
 
537 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  30.15 
 
 
537 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3278  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  30.61 
 
 
554 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0146118  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  34.44 
 
 
508 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0339  monooxygenase, FAD-binding  26.98 
 
 
534 aa  125  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0305956  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  30.77 
 
 
502 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  29.02 
 
 
502 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 
499 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  30.18 
 
 
537 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  30.77 
 
 
502 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5443  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase; 3-(3-hydroxy-phenyl)propionate hydroxylase FAD/NAD(P)-binding  30 
 
 
547 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728003  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1226  FAD-dependent oxidoreductase  27.11 
 
 
588 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.240433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>