75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3885 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  58.77 
 
 		 125 aa  133  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3323  protein of unknown function DUF35  57.89 
 
 		 125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00494403  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  45 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  38.68 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3313  hypothetical protein  41.9 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3568  hypothetical protein  36.54 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2106  hypothetical protein  41 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.283808  normal  0.0319762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3951  hypothetical protein  37.86 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26677  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  42.27 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  36.89 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  32.2 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.3 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  40.48 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  32.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  35.54 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  37.04 
 
 		 417 aa  57.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  35.54 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  35.54 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  39.5 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  39.5 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  30.97 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  28.93 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  37.62 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  36.44 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  33.87 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  34.62 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  34.86 
 
 		 417 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  31.76 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  34.65 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  32.08 
 
 		 144 aa  50.8  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  29.81 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  32.97 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  30.59 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  31.36 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  28.38 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  31.4 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  28.93 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  28.92 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4070  hypothetical protein  33.04 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322816  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  31.03 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1310  hypothetical protein  26.27 
 
 		 151 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  33.67 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  29.63 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3600  hypothetical protein  29.31 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0665674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  27.12 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  31.03 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  43.59 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4606  hypothetical protein  29.89 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  32.04 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1359  protein of unknown function DUF35  43.14 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.488871 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  44.07 
 
 		 123 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  24.77 
 
 		 157 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  31.03 
 
 		 137 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  33.67 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  29.89 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.63 
 
 		 418 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.76 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  28.74 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  25.29 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3255  putative short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 413 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.695501  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  26.74 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  31.33 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>