37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1359 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1359  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 125 aa  249  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.488871 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  34.96 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  34.26 
 
 		 417 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  34.78 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  34.26 
 
 		 417 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  34.07 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  34.15 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1485  hypothetical protein  38.2 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  34.04 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  0.0256768 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  33.71 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  31.52 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  29.03 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  27.12 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  31.4 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  31.33 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  32.56 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3932  protein of unknown function DUF35  30.1 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  30.43 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  24.78 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  35.79 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  30.12 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  32.22 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  26.51 
 
 		 182 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  25.93 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3885  hypothetical protein  43.14 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  38.98 
 
 		 136 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  27.47 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  27.47 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  27.71 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  30.59 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  33.82 
 
 		 1166 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  34 
 
 		 133 aa  40  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  29.17 
 
 		 131 aa  40  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>