93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2593 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  100 
 
 
280 aa  557  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  72.06 
 
 
389 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01768  hypothetical protein  36.75 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.228505  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6725  hypothetical protein  30.66 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5615  hypothetical protein  31.82 
 
 
179 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.279853  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0861  hypothetical protein  30.77 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2551  hypothetical protein  31.67 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5832  hypothetical protein  31.25 
 
 
179 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.927263  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2080  hypothetical protein  29.47 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.884925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1342  hypothetical protein  35.48 
 
 
226 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.429693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0173  hypothetical protein  35.57 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2934  hypothetical protein  35.79 
 
 
200 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0299987  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1544  hypothetical protein  36.22 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0293352  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2134  hypothetical protein  28.16 
 
 
213 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.181695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3640  hypothetical protein  33.15 
 
 
204 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.827146  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4587  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3938  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2941  hypothetical protein  27.68 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4276  hypothetical protein  35.15 
 
 
198 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5253  hypothetical protein  29.17 
 
 
220 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.545904  normal  0.544108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7306  hypothetical protein  38.38 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1089  hypothetical protein  33.7 
 
 
209 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2785  protein of unknown function DUF1653  45.21 
 
 
77 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741304  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1386  hypothetical protein  27.41 
 
 
446 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2478  protein of unknown function DUF1653  42.19 
 
 
80 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1162  hypothetical protein  35.62 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437423  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0783  hypothetical protein  32.45 
 
 
218 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45090  hypothetical protein  35.59 
 
 
208 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  40.24 
 
 
93 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3837  hypothetical protein  35.03 
 
 
208 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.178555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  43.94 
 
 
77 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  44.59 
 
 
99 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3807  hypothetical protein  46.03 
 
 
78 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3924  hypothetical protein  25.52 
 
 
203 aa  55.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.924156 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0831  hypothetical protein  32.67 
 
 
315 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.812285  normal  0.831839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  43.33 
 
 
76 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6187  hypothetical protein  33.68 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0461  hypothetical protein  44.83 
 
 
77 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  44.62 
 
 
80 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1277  protein of unknown function DUF1653  45 
 
 
78 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  41.18 
 
 
124 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3389  hypothetical protein  42.31 
 
 
85 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2147  hypothetical protein  41.18 
 
 
124 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3955  hypothetical protein  32.02 
 
 
201 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2727  protein of unknown function DUF1653  42.31 
 
 
85 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  44.44 
 
 
71 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4748  hypothetical protein  26.5 
 
 
215 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3218  hypothetical protein  42.47 
 
 
78 aa  52.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1072  hypothetical protein  26.7 
 
 
206 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.779846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0918  hypothetical protein  30.81 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1072  hypothetical protein  45.9 
 
 
72 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944533  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  43.1 
 
 
76 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3381  hypothetical protein  32.63 
 
 
208 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2015  hypothetical protein  29.12 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3515  hypothetical protein  40.58 
 
 
87 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452324  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3429  hypothetical protein  42.62 
 
 
65 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14460  hypothetical protein  41.27 
 
 
78 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.690705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  38.81 
 
 
160 aa  48.9  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  39.66 
 
 
81 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  42.37 
 
 
79 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  41.82 
 
 
79 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21700  hypothetical protein  32.17 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.174472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00754  hypothetical protein  40.32 
 
 
82 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5662  protein of unknown function DUF1653  44.26 
 
 
64 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5371  hypothetical protein  39.13 
 
 
90 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3298  hypothetical protein  37.93 
 
 
73 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.799272  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1170  hypothetical protein  46.67 
 
 
72 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.453785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  40.68 
 
 
76 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2232  hypothetical protein  46.67 
 
 
72 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3288  hypothetical protein  39.39 
 
 
78 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.264781  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2219  hypothetical protein  38.1 
 
 
79 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.407706  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1796  hypothetical protein  38.98 
 
 
85 aa  46.2  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1654  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1678  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  37.31 
 
 
82 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0715  hypothetical protein  29.65 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.178697  hitchhiker  0.00000364187 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0071  hypothetical protein  37.93 
 
 
70 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.309822  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  46.67 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3877  TonB box-like  39.68 
 
 
78 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121444  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1755  hypothetical protein  44.07 
 
 
72 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4116  hypothetical protein  28.19 
 
 
152 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2138  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109451  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  34.92 
 
 
75 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3604  hypothetical protein  38.1 
 
 
83 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136682  normal  0.268086 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1969  hypothetical protein  34.48 
 
 
75 aa  43.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130857 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3731  hypothetical protein  42.37 
 
 
72 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787713  normal  0.411943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3667  hypothetical protein  32.31 
 
 
75 aa  43.1  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1482  hypothetical protein  39.39 
 
 
69 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0791  hypothetical protein  32.24 
 
 
209 aa  42.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8117  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3485  hypothetical protein  32.58 
 
 
289 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1382  hypothetical protein  33.51 
 
 
252 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>