72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2498 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  100 
 
 
76 aa  160  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  92.11 
 
 
79 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  63.89 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  67.14 
 
 
76 aa  95.5  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  73.85 
 
 
71 aa  94.7  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  72.13 
 
 
82 aa  93.6  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  63.77 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2147  hypothetical protein  63.64 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  63.64 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0461  hypothetical protein  63.08 
 
 
77 aa  90.1  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14460  hypothetical protein  55.26 
 
 
78 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.690705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  59.15 
 
 
80 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2727  protein of unknown function DUF1653  63.64 
 
 
85 aa  88.2  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5371  hypothetical protein  62.5 
 
 
90 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400948 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3389  hypothetical protein  63.64 
 
 
85 aa  87.8  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  70 
 
 
75 aa  87.4  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3515  hypothetical protein  56.34 
 
 
87 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452324  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3218  hypothetical protein  64.06 
 
 
78 aa  87  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2219  hypothetical protein  65.08 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.407706  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3288  hypothetical protein  54.93 
 
 
78 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.264781  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  65.57 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2478  protein of unknown function DUF1653  64.52 
 
 
80 aa  84.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3807  hypothetical protein  61.9 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3877  TonB box-like  54.93 
 
 
78 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121444  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  64.06 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0071  hypothetical protein  57.14 
 
 
70 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.309822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2785  protein of unknown function DUF1653  60.29 
 
 
77 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741304  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1277  protein of unknown function DUF1653  61.29 
 
 
78 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  58.46 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  62.5 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1969  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  81.3  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130857 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  65.57 
 
 
76 aa  80.9  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1654  hypothetical protein  51.39 
 
 
83 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00754  hypothetical protein  60.66 
 
 
82 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1796  hypothetical protein  59.38 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0835  hypothetical protein  56 
 
 
75 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3090  hypothetical protein  53.03 
 
 
71 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2138  hypothetical protein  51.39 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109451  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  64.29 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1678  hypothetical protein  51.39 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3604  hypothetical protein  51.39 
 
 
83 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136682  normal  0.268086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3298  hypothetical protein  53.97 
 
 
73 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.799272  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2668  hypothetical protein  52.31 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3667  hypothetical protein  47.83 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1235  hypothetical protein  47.62 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1170  hypothetical protein  58.06 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.453785  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2232  hypothetical protein  58.06 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333234  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  59.02 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1755  hypothetical protein  58.06 
 
 
72 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2249  hypothetical protein  43.75 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.917639  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3731  hypothetical protein  54.41 
 
 
72 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787713  normal  0.411943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4763  hypothetical protein  51.47 
 
 
72 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4240  hypothetical protein  51.47 
 
 
72 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.532997  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5411  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.94574 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3491  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0176003  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0846  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3046  hypothetical protein  51.92 
 
 
213 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1234  protein of unknown function DUF1653  54.84 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1401  hypothetical protein  56.25 
 
 
85 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4875  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1665  hypothetical protein  56.25 
 
 
85 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.451989  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1072  hypothetical protein  41.43 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944533  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5662  protein of unknown function DUF1653  43.75 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2516  hypothetical protein  45.28 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0574575  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1482  hypothetical protein  45.31 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1376  protein of unknown function DUF1653  43.75 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal  0.0947421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1440  protein of unknown function DUF1653  43.75 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500044  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  40.68 
 
 
280 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1378  hypothetical protein  48.33 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3429  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.364094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0394  protein of unknown function DUF1653  42.62 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.25684 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  38.98 
 
 
389 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>