70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2219 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2219  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  166  7e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.407706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  77.46 
 
 		 75 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1969  hypothetical protein  74.65 
 
 		 75 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2147  hypothetical protein  56 
 
 		 124 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  56 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  59.7 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  60.81 
 
 		 76 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3877  TonB box-like  61.54 
 
 		 78 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121444  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  61.54 
 
 		 80 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3515  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452324  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3667  hypothetical protein  54.41 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2138  hypothetical protein  56.92 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109451  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3604  hypothetical protein  56.92 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136682  normal  0.268086 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  51.25 
 
 		 81 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0461  hypothetical protein  56.92 
 
 		 77 aa  89.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1654  hypothetical protein  55.38 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2478  protein of unknown function DUF1653  52 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3288  hypothetical protein  58.46 
 
 		 78 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.264781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  55.88 
 
 		 99 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5371  hypothetical protein  60.32 
 
 		 90 aa  88.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400948 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0071  hypothetical protein  52.24 
 
 		 70 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.309822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  65.08 
 
 		 79 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1678  hypothetical protein  55.38 
 
 		 83 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2668  hypothetical protein  60.32 
 
 		 76 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14460  hypothetical protein  53.73 
 
 		 78 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.690705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  65.08 
 
 		 76 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  57.81 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  63.93 
 
 		 71 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  56.92 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3807  hypothetical protein  58.73 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00754  hypothetical protein  55.88 
 
 		 82 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  56.06 
 
 		 93 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3389  hypothetical protein  58.73 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3218  hypothetical protein  52.7 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2727  protein of unknown function DUF1653  58.73 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1277  protein of unknown function DUF1653  53.73 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  49.25 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3298  hypothetical protein  50.72 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.799272  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1796  hypothetical protein  53.23 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2249  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.917639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3090  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  72  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0835  hypothetical protein  52.17 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  51.85 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1235  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2785  protein of unknown function DUF1653  48.44 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3046  hypothetical protein  49.06 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  43.84 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1170  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.453785  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2232  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1755  hypothetical protein  42.67 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1401  hypothetical protein  49.09 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1665  hypothetical protein  49.09 
 
 		 85 aa  57  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.451989  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3731  hypothetical protein  44.62 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787713  normal  0.411943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1234  protein of unknown function DUF1653  47.69 
 
 		 68 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.787623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4763  hypothetical protein  44.62 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5411  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94574 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4875  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0846  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3491  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0176003  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4240  hypothetical protein  43.08 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.532997  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1482  hypothetical protein  42.03 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1072  hypothetical protein  40.91 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944533  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5662  protein of unknown function DUF1653  38.1 
 
 		 64 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1440  protein of unknown function DUF1653  40.3 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1376  protein of unknown function DUF1653  37.68 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal  0.0947421 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3429  hypothetical protein  39.68 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  38.1 
 
 		 280 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2516  hypothetical protein  47.83 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0574575  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1378  hypothetical protein  40.32 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>