20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1378 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1378  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0394  protein of unknown function DUF1653  55.17 
 
 
122 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.25684 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  41.18 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  42.47 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  48.33 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  45.9 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  43.33 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  41.94 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  43.55 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3046  hypothetical protein  29.87 
 
 
213 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  43.48 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1969  hypothetical protein  34.33 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  39.66 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2219  hypothetical protein  40.32 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.407706  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  39.34 
 
 
82 aa  40.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  38.03 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5662  protein of unknown function DUF1653  39.06 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  38.55 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>