69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3288 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3288  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.264781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3515  hypothetical protein  94.87 
 
 		 87 aa  156  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3877  TonB box-like  84.42 
 
 		 78 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121444  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  80.82 
 
 		 80 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1654  hypothetical protein  75.68 
 
 		 83 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3604  hypothetical protein  75.68 
 
 		 83 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136682  normal  0.268086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2138  hypothetical protein  75.68 
 
 		 83 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109451  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1678  hypothetical protein  74.32 
 
 		 83 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14460  hypothetical protein  70.67 
 
 		 78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.690705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2147  hypothetical protein  71.62 
 
 		 124 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  71.62 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3667  hypothetical protein  63.77 
 
 		 75 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  67.19 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  63.77 
 
 		 76 aa  94.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  68.25 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2219  hypothetical protein  58.46 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.407706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  60.94 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0461  hypothetical protein  56.34 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0071  hypothetical protein  58.21 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.309822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  56.34 
 
 		 79 aa  87.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1969  hypothetical protein  55.38 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130857 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  58.21 
 
 		 77 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  54.93 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2478  protein of unknown function DUF1653  56.72 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  60.94 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5371  hypothetical protein  58.06 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  59.02 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0835  hypothetical protein  60 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2668  hypothetical protein  48.68 
 
 		 76 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  60.66 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  52.31 
 
 		 81 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  56.92 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3298  hypothetical protein  50.75 
 
 		 73 aa  78.2  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.799272  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3389  hypothetical protein  52.94 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2727  protein of unknown function DUF1653  52.94 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1277  protein of unknown function DUF1653  52.94 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3046  hypothetical protein  58.46 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3807  hypothetical protein  53.03 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1796  hypothetical protein  55.38 
 
 		 85 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00754  hypothetical protein  47.83 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  57.89 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3218  hypothetical protein  52.31 
 
 		 78 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3090  hypothetical protein  50.75 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  53.12 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2785  protein of unknown function DUF1653  53.62 
 
 		 77 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2249  hypothetical protein  41.79 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.917639  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1234  protein of unknown function DUF1653  53.03 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.787623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1235  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1755  hypothetical protein  52.54 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2232  hypothetical protein  50.82 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333234  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1170  hypothetical protein  50.82 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.453785  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  52.54 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1665  hypothetical protein  49.09 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.451989  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3731  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787713  normal  0.411943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1401  hypothetical protein  49.09 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4763  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5411  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94574 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3491  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0176003  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4875  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0846  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4240  hypothetical protein  52.38 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.532997  normal  0.112491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1440  protein of unknown function DUF1653  45.07 
 
 		 69 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1482  hypothetical protein  45.07 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1072  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944533  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5662  protein of unknown function DUF1653  42.86 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1376  protein of unknown function DUF1653  43.66 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal  0.0947421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2516  hypothetical protein  46 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0574575  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  39.39 
 
 		 280 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5830  hypothetical protein  37.88 
 
 		 389 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>