54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2516 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2516  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  157  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0574575  normal  0.50038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  62.5 
 
 
77 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  60.42 
 
 
71 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1654  hypothetical protein  57.45 
 
 
83 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2138  hypothetical protein  57.45 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109451  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1678  hypothetical protein  57.45 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3604  hypothetical protein  57.45 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136682  normal  0.268086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  55.77 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14460  hypothetical protein  56 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.690705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3298  hypothetical protein  50 
 
 
73 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.799272  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  60.47 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  44.78 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1234  protein of unknown function DUF1653  46.88 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.787623  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  59.52 
 
 
82 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2147  hypothetical protein  51.02 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  51.02 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2478  protein of unknown function DUF1653  54.17 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  46.15 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2727  protein of unknown function DUF1653  53.06 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3389  hypothetical protein  53.06 
 
 
85 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1277  protein of unknown function DUF1653  59.52 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3877  TonB box-like  46 
 
 
78 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121444  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1235  hypothetical protein  44.23 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3515  hypothetical protein  48 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0461  hypothetical protein  46.81 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  48.08 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  45.28 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2785  protein of unknown function DUF1653  38.67 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741304  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  40.58 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0071  hypothetical protein  44.44 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.309822  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  50 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1969  hypothetical protein  48.94 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3288  hypothetical protein  46 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.264781  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2668  hypothetical protein  44.9 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  53.49 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3218  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3090  hypothetical protein  44 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  42.31 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00754  hypothetical protein  41.94 
 
 
82 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5371  hypothetical protein  52.38 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.400948 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1170  hypothetical protein  42.86 
 
 
72 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.453785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1796  hypothetical protein  46 
 
 
85 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2232  hypothetical protein  42.86 
 
 
72 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1755  hypothetical protein  41.54 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2249  hypothetical protein  45.65 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.917639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2219  hypothetical protein  47.83 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.407706  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  47.73 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  41.54 
 
 
239 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0835  hypothetical protein  44.44 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3807  hypothetical protein  46 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  44.3  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  39.13 
 
 
280 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3731  hypothetical protein  45 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787713  normal  0.411943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3046  hypothetical protein  36.17 
 
 
213 aa  40  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>