53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1482 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1482  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  146  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.616449  normal  0.408245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1440  protein of unknown function DUF1653  86.96 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1376  protein of unknown function DUF1653  88.41 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal  0.0947421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1072  hypothetical protein  70.97 
 
 		 72 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.944533  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5662  protein of unknown function DUF1653  70.97 
 
 		 64 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.891612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3429  hypothetical protein  64.52 
 
 		 65 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1277  protein of unknown function DUF1653  54.05 
 
 		 78 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195664  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0262  hypothetical protein  48.61 
 
 		 71 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295512  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3389  hypothetical protein  55.07 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  52.38 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2727  protein of unknown function DUF1653  53.62 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0461  hypothetical protein  46.88 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5371  hypothetical protein  49.23 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.400948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14460  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.690705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2478  protein of unknown function DUF1653  50 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  52.94 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  46.97 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3218  hypothetical protein  47.89 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1654  hypothetical protein  47.14 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1678  hypothetical protein  47.14 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  45.07 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3807  hypothetical protein  45.59 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1969  hypothetical protein  43.55 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  46.88 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2219  hypothetical protein  42.03 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.407706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  46.03 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3604  hypothetical protein  45.71 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.136682  normal  0.268086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2138  hypothetical protein  45.71 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109451  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3515  hypothetical protein  43.66 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3288  hypothetical protein  45.07 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.264781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3298  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.799272  normal  0.332691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1303  hypothetical protein  46.67 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  45.31 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00754  hypothetical protein  44.62 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3877  TonB box-like  44.44 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.121444  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2147  hypothetical protein  42.03 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  42.03 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2785  protein of unknown function DUF1653  45.59 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0835  hypothetical protein  47.54 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1474  PKD  42.62 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2896  hypothetical protein  49.15 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1234  protein of unknown function DUF1653  44.26 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.787623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  44.07 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3090  hypothetical protein  39.39 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3667  hypothetical protein  37.29 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0628867  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0071  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.309822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2668  hypothetical protein  43.55 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2593  hypothetical protein  39.39 
 
 		 280 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2249  hypothetical protein  35.48 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.917639  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1796  hypothetical protein  43.75 
 
 		 85 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1235  hypothetical protein  36.51 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>