More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1709 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1709  major facilitator transporter  100 
 
 
404 aa  780    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6915  major facilitator transporter  56.92 
 
 
401 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1453  major facilitator transporter  59.84 
 
 
401 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6375  major facilitator transporter  59.84 
 
 
401 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  32.4 
 
 
399 aa  164  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  32.4 
 
 
399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  32.4 
 
 
399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  32.8 
 
 
426 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  32.34 
 
 
394 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  32.34 
 
 
394 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  32.34 
 
 
394 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  32.34 
 
 
394 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  32.34 
 
 
394 aa  154  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  35.11 
 
 
400 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
399 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
406 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 
406 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  27.47 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  31.51 
 
 
402 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  31.52 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  31.69 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  34.94 
 
 
394 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  36.5 
 
 
415 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
397 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
394 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  28.61 
 
 
415 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
403 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  30.96 
 
 
393 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0275  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 
413 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.434106 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  32.07 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2266  major facilitator transporter  32.8 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.4947  normal  0.149356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  31.67 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3694  major facilitator transporter  33.86 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0166354  normal  0.86684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  31.77 
 
 
394 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  31.51 
 
 
394 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  32.91 
 
 
391 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  31.33 
 
 
404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4533  major facilitator transporter  33.96 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.229762  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3830  major facilitator transporter  33.96 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237049  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  31.51 
 
 
394 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 
389 aa  139  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3733  major facilitator transporter  32.78 
 
 
411 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431016  normal  0.616797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  32.15 
 
 
405 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  31.54 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  32.27 
 
 
405 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  32.27 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  32.27 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  32.17 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  32.43 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  29.97 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  34.49 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
398 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
429 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  30.68 
 
 
399 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  30.25 
 
 
429 aa  133  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  31.53 
 
 
399 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  34.4 
 
 
389 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  31.87 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  34.33 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  26.61 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  30.41 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4909  major facilitator transporter  33.07 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122215  hitchhiker  0.000329604 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  34.33 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  34.33 
 
 
400 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  29 
 
 
399 aa  131  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  29 
 
 
399 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  31.59 
 
 
399 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  31.05 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  34.04 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  28.73 
 
 
399 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  31.84 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  32.16 
 
 
390 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  30.68 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  30.68 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5556  major facilitator transporter  32.78 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  31.56 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3001  major facilitator transporter  31.69 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3198  major facilitator family transporter  32.82 
 
 
329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  29.89 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  32.55 
 
 
404 aa  126  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  29.44 
 
 
389 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  29.44 
 
 
389 aa  126  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3355  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
409 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.141056  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  30.6 
 
 
401 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.77 
 
 
404 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  31.79 
 
 
401 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
396 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0717  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
405 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.532097  normal  0.452482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  31.52 
 
 
411 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0355  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
422 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>