More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1440 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  879    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  86.01 
 
 		 429 aa  767    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  64.82 
 
 		 434 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  65.64 
 
 		 434 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  64.93 
 
 		 434 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  56.25 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  55.16 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  58.74 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  55.74 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  56.16 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  54.25 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  55.42 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  55.17 
 
 		 415 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  53.77 
 
 		 415 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  54.55 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  53.03 
 
 		 427 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  57.18 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  50.97 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  53.21 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  54.78 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  55.83 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3705  hypothetical protein  54 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  54.37 
 
 		 723 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1795  protein of unknown function DUF323  53.16 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  53.4 
 
 		 419 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  54.37 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1759  hypothetical protein  53.27 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.517668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  52.37 
 
 		 437 aa  420  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  51.44 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  53.49 
 
 		 412 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  50.48 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  51.67 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  52.78 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1311  hypothetical protein  50.73 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5394  hypothetical protein  50.61 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3413  protein of unknown function DUF323  50.23 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  51.77 
 
 		 408 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3090  hypothetical protein  51.34 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  51.44 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2253  hypothetical protein  51.65 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201022  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  51.75 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  50.86 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0356  protein of unknown function DUF323  50.71 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.199231  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  46.5 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  52.26 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  51.3 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  51.78 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  48.67 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  51.31 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  50.35 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3542  protein of unknown function DUF323  47.88 
 
 		 420 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3218  hypothetical protein  48.11 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  51.42 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0022  hypothetical protein  52.25 
 
 		 408 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  52.38 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0115  hypothetical protein  50.12 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.280848  normal  0.0377747 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0040  hypothetical protein  52.51 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  46.57 
 
 		 383 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  53.33 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  50.59 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0048  hypothetical protein  52.01 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  53.6 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  51.31 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  49.76 
 
 		 455 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1379  hypothetical protein  52.61 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  51.31 
 
 		 411 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0159  hypothetical protein  48.66 
 
 		 383 aa  375  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  45.48 
 
 		 412 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  50.84 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  45.26 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01891  hypothetical protein  47.84 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3660  protein of unknown function DUF323  50 
 
 		 418 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  50.12 
 
 		 411 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4446  protein of unknown function DUF323  46.72 
 
 		 388 aa  359  6e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0334841  normal  0.294946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  44.31 
 
 		 385 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  44.74 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6100  protein of unknown function DUF323  46.56 
 
 		 398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13318  hypothetical protein  41.56 
 
 		 386 aa  347  3e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  39.03 
 
 		 436 aa  319  6e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  34.26 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  36.17 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  34.23 
 
 		 439 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  32.29 
 
 		 506 aa  193  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  33.95 
 
 		 468 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  35.12 
 
 		 487 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  33.11 
 
 		 442 aa  186  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  33.82 
 
 		 433 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  33.18 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  33.64 
 
 		 446 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  32.36 
 
 		 444 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  33.64 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  32.94 
 
 		 424 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  33.1 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  33.18 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  32.52 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  31.7 
 
 		 374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  29.67 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  30.72 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  32.24 
 
 		 766 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  30.43 
 
 		 416 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>