220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3416 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3416  peptidase A24A domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1565  peptidase A24A domain-containing protein  84.65 
 
 		 254 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1839  peptidase A24A domain protein  49.8 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.639181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4469  peptidase A24A prepilin type IV  44.1 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  28.57 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06010  Prepilin peptidase  31.43 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  29.36 
 
 		 259 aa  95.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2410  peptidase A24A domain protein  26.27 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0800  prepilin peptidase  29.75 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  28.87 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2160  peptidase A24A domain protein  33.2 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.98 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  26.69 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  28 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  30.62 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  28 
 
 		 274 aa  85.1  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  27.53 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2571  Type IV leader peptidase family protein  26.69 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  30.36 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06881  leader peptidase (prepilin peptidase) / N-methyltransferase  25.78 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2273  signal peptidase type IV  27.09 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  29.06 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0245  type 4 prepilin peptidase PilD  29.03 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0214  peptidase A24A domain-containing protein  28.33 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.156269  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1047  peptidase A24A domain-containing protein  29.83 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00424569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  28.69 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  28.98 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0671  peptidase A24A domain protein  30.93 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1550  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.22 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0916806 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1138  peptidase A24A domain-containing protein  27.16 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.120004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0244  peptidase A24A domain protein  25.42 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  28.17 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0992  peptidase A24A domain-containing protein  26.21 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0044171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1508  peptidase A24A domain-containing protein  29.31 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000599925  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.17 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0671  peptidase A24A domain protein  30.41 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  28.33 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0501  peptidase A24A domain-containing protein  27.59 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.449836  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0062  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.17 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000282125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0971  peptidase A24 N- domain-containing protein  25.76 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436062  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2849  Prepilin peptidase  28.36 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.993621  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.02 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1480  Prepilin peptidase  28.89 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0149  peptidase A24A domain-containing protein  30.73 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0637  prepilin peptidase  30.94 
 
 		 299 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0982  prepilin peptidase  27.71 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  28 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2022  prepilin peptidase  29.21 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0169642  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1117  peptidase A24A domain protein  24.71 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1391  prepilin peptidase  26.88 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  31.85 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  28.24 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  29.25 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  29.25 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  26.57 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  26.85 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  27.87 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0021  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.77 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1027  peptidase A24A domain-containing protein  23.85 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.773434  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  28.77 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0946  peptidase A24A domain-containing protein  31.94 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1503  peptidase A24A domain protein  29.79 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0203162 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0311  peptidase A24A domain protein  28.63 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  29.04 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  28.37 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04888  type IV prepilin peptidase  25.19 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.528237  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  27.01 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  26.75 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  26.3 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  28.77 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  26.57 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2985  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  28.35 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.749856 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1126  peptidase A24A domain protein  26.11 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  25.27 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  27.27 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1502  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  30.04 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0199  Prepilin peptidase  25.28 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3131  peptidase A24A domain protein  27.08 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.91 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  29.3 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1264  peptidase A24 N- domain-containing protein  34.15 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0142406  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0204  peptidase A24A domain protein  25.28 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2094  leader peptidase PilD  27.11 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.91 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12070  type IV Pilus Prepilin peptidase, PilD  28.21 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0974512  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3425  prepilin peptidase  27.91 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  27.37 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1935  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  36.03 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0768  prepilin peptidase  27.97 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.312939  normal  0.130991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1422  Prepilin peptidase  27.14 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  24.33 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0067  prepilin peptidase  31.29 
 
 		 299 aa  62  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000398253  normal  0.330687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58770  type 4 prepilin peptidase PilD  27.07 
 
 		 290 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.896389  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0682  peptidase A24A domain-containing protein  38.2 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.301277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  26.55 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  37.07 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1173  peptidase A24A domain-containing protein  27.92 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000679312  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0697  saccharopine dehydrogenase  28.57 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0996  peptidase A24A-like  23.14 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0427  peptidase A24A domain protein  36.15 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>