49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1625 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1625  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 260 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.816292 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1338  TPR repeat-containing protein  63.08 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4560  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  29.61 
 
 		 636 aa  53.1  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 593 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 808 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.5 
 
 		 837 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 357 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 566 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  35.48 
 
 		 780 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 780 aa  45.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.86 
 
 		 668 aa  45.8  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 717 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 717 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 568 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.82 
 
 		 733 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0105  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 689 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 1737 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  45.12 
 
 		 626 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4690  transcriptional regulator domain protein  35.45 
 
 		 521 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  36.09 
 
 		 935 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03573  tetratricopeptide repeat family  31.3 
 
 		 690 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432087  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 1104 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 914 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  27.94 
 
 		 924 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.15 
 
 		 875 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  36.71 
 
 		 540 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3939  sporulation domain-containing protein  30.92 
 
 		 483 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  20.67 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 573 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  44.29 
 
 		 639 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.65 
 
 		 769 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  22.44 
 
 		 321 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 579 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 357 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  32.65 
 
 		 637 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 761 aa  42.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  43.84 
 
 		 766 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  30.12 
 
 		 676 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 205 aa  42.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4144  Zinc finger-domain-containing protein  37.25 
 
 		 1124 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000494225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>