More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0483 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.289001  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.53 
 
 
260 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
257 aa  175  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
259 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
285 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
257 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965402  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
262 aa  165  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
256 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735777  normal  0.247355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
265 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.9 
 
 
247 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2147  sorbitol dehydrogenase  42.47 
 
 
256 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000207425  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
262 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245464  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  42.69 
 
 
258 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
262 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
250 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
248 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
262 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  41.31 
 
 
258 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  42.69 
 
 
258 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  40.15 
 
 
260 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  37.7 
 
 
247 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.4 
 
 
247 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  40.15 
 
 
260 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  43.08 
 
 
258 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
257 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
256 aa  158  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.46 
 
 
253 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
284 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  42.31 
 
 
258 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  42.31 
 
 
276 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  42.31 
 
 
276 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
272 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
255 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5688  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
260 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
286 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
280 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
256 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0881608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
285 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.96 
 
 
249 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
261 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
248 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
255 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
248 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  37.16 
 
 
266 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
257 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  40 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
248 aa  152  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.13 
 
 
250 aa  152  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
256 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
248 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
261 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0872  sorbitol dehydrogenase  41.06 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1031  sorbitol dehydrogenase  41.06 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.466971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0868  sorbitol dehydrogenase  41.06 
 
 
258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0692  sorbitol dehydrogenase  41.06 
 
 
258 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  38.52 
 
 
247 aa  151  8e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.55 
 
 
246 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
248 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
247 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
269 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  40.15 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.04 
 
 
246 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0076  sorbitol dehydrogenase  40.15 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0187  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
259 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.47 
 
 
251 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
258 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
248 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  40.15 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  39.38 
 
 
257 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  40.15 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0935  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.89 
 
 
251 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
255 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
255 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
255 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.13 
 
 
246 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
249 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.74 
 
 
250 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.8 
 
 
286 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4264  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.5 
 
 
255 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
287 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
262 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
252 aa  148  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.8 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  41.9 
 
 
254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3295  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.28 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3369  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.5 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.589225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
248 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0987  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.5 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3400  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  normal  0.358288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>