136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1817 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1817  putative siderophore biosynthesis oxidoreductase protein  100 
 
 
462 aa  956    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2835  monooxygenase  47.11 
 
 
427 aa  388  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0408  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.95 
 
 
431 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0659  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  47.56 
 
 
471 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0217  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.79 
 
 
502 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4057  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.71 
 
 
505 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4219  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  46.36 
 
 
457 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3333  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.76 
 
 
449 aa  349  6e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2411  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.52 
 
 
505 aa  343  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3030  siderophore biosynthesis protein  40.81 
 
 
498 aa  340  5e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0592  lysine/ornithine N-monooxygenase  41.82 
 
 
447 aa  335  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.301691  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1454  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.96 
 
 
496 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1054  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.08 
 
 
463 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0286  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  43.15 
 
 
455 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0513  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.45 
 
 
458 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1510  siderophore biosynthesis protein  42.12 
 
 
496 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2840  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.11 
 
 
442 aa  331  2e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000828048  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.72 
 
 
495 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.217805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1630  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.95 
 
 
445 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0197  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  44.18 
 
 
456 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0156088 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0135  siderophore biosynthetis protein  38.74 
 
 
442 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02102  hypothetical protein  41.38 
 
 
468 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1810  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.64 
 
 
442 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.633774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2550  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  42.09 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3173  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.41 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1656  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.57 
 
 
501 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000130755 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2708  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.11 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.2 
 
 
501 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.242413 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2730  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.88 
 
 
501 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.100586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3460  L-lysine 6-monooxygenase  40.14 
 
 
434 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2739  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  41.07 
 
 
428 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.234234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1073  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  40.62 
 
 
502 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118854  normal  0.903474 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2546  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  38.05 
 
 
432 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4294  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.95 
 
 
432 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.093868  hitchhiker  0.0000660921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2447  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  38.05 
 
 
432 aa  300  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3189  lysine N6-hydroxylase/L-ornithine N5-oxygenase family protein  38.05 
 
 
432 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.603333  normal  0.0134512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1802  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  39.12 
 
 
496 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000066726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0211  L-lysine 6-monooxygenase  38.21 
 
 
427 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.606934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0025  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.55 
 
 
437 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.227506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5059  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  36.61 
 
 
442 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3254  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  35.78 
 
 
435 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4631  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.49 
 
 
445 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0919  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.01 
 
 
442 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.245016  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3179  L-lysine 6-monooxygenase IucD  34.37 
 
 
425 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.856954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0280  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.38 
 
 
441 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0711  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucD  33.48 
 
 
442 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0783  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.48 
 
 
442 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0950  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.72 
 
 
444 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5731  L-ornithine N5-oxygenase  34.35 
 
 
438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1946  hypothetical protein  33.41 
 
 
445 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2520  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  34.72 
 
 
425 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.730683 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0278  siderophore biosynthesis protein IucD  33.96 
 
 
437 aa  230  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0571  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.57 
 
 
434 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3091  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.53 
 
 
454 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.169338  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4809  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.95 
 
 
452 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3318  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.37 
 
 
441 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00871217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1811  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.81 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1046  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.94 
 
 
437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0586  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.82 
 
 
444 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6320  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  33.17 
 
 
446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3275  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.28 
 
 
430 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1093  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  32.55 
 
 
443 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5066  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.53 
 
 
442 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2654  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.35 
 
 
445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000731675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1944  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  31.6 
 
 
468 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186781  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1179  l-ornithine 5-monooxygenase  31.6 
 
 
468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0820477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1623  l-ornithine 5-monooxygenase  31.6 
 
 
468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0286  l-ornithine 5-monooxygenase  31.6 
 
 
517 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0287172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0875  l-ornithine 5-monooxygenase  31.6 
 
 
468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.635923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2090  l-ornithine 5-monooxygenase  31.22 
 
 
495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869348  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1929  putative L-ornithine 5-monooxygenase MbaA  31.22 
 
 
468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4789  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.68 
 
 
458 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00013329  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2416  l-ornithine 5-monooxygenase  30.97 
 
 
504 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0539899  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3691  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.4 
 
 
432 aa  160  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1163  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.44 
 
 
458 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1643  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.44 
 
 
458 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0478364  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1618  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.44 
 
 
458 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4074  L-ornithine 5-monooxygenase  29 
 
 
456 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0146729  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1595  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.14 
 
 
454 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0832377  hitchhiker  0.00131609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1561  lysine/ornithine N-monooxygenase  29.51 
 
 
458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000104933  normal  0.191057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1540  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.21 
 
 
458 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.310035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4036  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.25 
 
 
462 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4488  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.09 
 
 
422 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2871  lysine/ornithine N-monooxygenase-like protein  29.51 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774332  normal  0.562088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3740  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.63 
 
 
439 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1825  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  28.21 
 
 
435 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3723  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.66 
 
 
452 aa  150  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0527  l-ornithine 5-monooxygenase  28.08 
 
 
456 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1859  L-ornithine N5-oxygenase  28.06 
 
 
445 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.886808  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3463  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.43 
 
 
444 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23385  hitchhiker  0.00214354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1345  L-ornithine 5-monooxygenase (L-ornithine N5-oxygenase)  31 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865314  normal  0.202415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2961  L-lysine 6-monooxygenase, putative  30.54 
 
 
440 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.480954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2874  L-ornithine N5-oxygenase  28.28 
 
 
443 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33810  L-ornithine N5-oxygenase  26.9 
 
 
443 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000120742  normal  0.0105626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2660  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  30.5 
 
 
448 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25600  L-ornithine N5-oxygenase-PvdA-like protein  27.68 
 
 
453 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3060  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  29.65 
 
 
439 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1749  L-lysine 6-monooxygenase (NADPH)  32.26 
 
 
444 aa  141  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0367243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2746  L-lysine 6-monooxygenase, putative  29.23 
 
 
439 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0296167  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02550  lysine/ornithine N-monooxygenase  30.14 
 
 
455 aa  140  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0324873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>