More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0893 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0893  transposase  100 
 
 		 294 aa  603  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  38.93 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  41.13 
 
 		 278 aa  198  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  39.49 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  40.43 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  40.43 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  40.43 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  38.87 
 
 		 268 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  38.87 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  36.03 
 
 		 270 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  40.86 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  43.19 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  43.19 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  43.19 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  43.19 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  43.19 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  43.19 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  43.19 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  43.19 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  38.68 
 
 		 276 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  39.05 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  35.92 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  35.92 
 
 		 273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  37.86 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  38.55 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  37.5 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  36.26 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  37.28 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  40.38 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  40.38 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  36.04 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  37.63 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  37.45 
 
 		 275 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  45.28 
 
 		 224 aa  169  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  36.4 
 
 		 265 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  36.76 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  36.76 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  36.76 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  36.76 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  36.76 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  36.76 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  36.4 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  36.4 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1794  transposase IS5 family protein  36.4 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0951166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2130  transposase, IS4 family protein  34.55 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3561  transposase, IS4 family protein  35.04 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.428349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  35.04 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  36.76 
 
 		 270 aa  162  9e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3422  transposase, IS4 family protein  34.42 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574466 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  36.43 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0151  transposase, IS4  40.08 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  37.35 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0241  transposase, IS4 family protein  34.4 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458028  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  34.67 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  38.24 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  38.24 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  38.24 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  36.43 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  38.24 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  38.24 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  37.32 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0762  transposase IS4 family protein  41.63 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0641157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  38.1 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  33.94 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  37.5 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  36.3 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  36.3 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  36.3 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1764  transposase, IS4 family protein  34.04 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  41.53 
 
 		 250 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  35.06 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1808  transposase, IS4 family protein  33.33 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.20953  normal  0.0264581 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  31.73 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  34.32 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  32.72 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  32.72 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  32.72 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  32.72 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>