40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2549 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  100 
 
 		 429 aa  846    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  99.07 
 
 		 429 aa  836    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  85.64 
 
 		 433 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  42.68 
 
 		 428 aa  302  6.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  31.78 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  34.08 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  30.73 
 
 		 425 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  33.46 
 
 		 401 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  26.27 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  26.44 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  27.21 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  24.66 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  31.68 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  27.41 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  27.69 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  26.88 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  24.16 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  24.15 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  25.36 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  25.72 
 
 		 453 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 512 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  23.37 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  26.83 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  29.56 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.42 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.42 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  28.92 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  25.95 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  21.05 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  27.93 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  31.71 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  30.89 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  30.91 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  24.56 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>