31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4166 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4166  plasmid stabilization system protein  100 
 
 		 96 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.105746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  52.13 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1846  plasmid stabilization system  33.33 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  35.23 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2216  plasmid stabilization system protein  33.33 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501987  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1299  plasmid stabilization system  38.46 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2504  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.580101 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3610  plasmid stabilization system  32.26 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2032  plasmid stabilization system  35.8 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4629  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.410487  normal  0.123158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3300  addiction module toxin, RelE/StbE family  33.33 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000161062  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0585  hypothetical protein  28.89 
 
 		 93 aa  47  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000997841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0159  plasmid stabilization system protein  31.46 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2208  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.05 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000269214  unclonable  0.00000000006105 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1263  plasmid stabilization system protein  30.34 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0593  plasmid stabilization system  30.68 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0773  plasmid stabilization system protein  37.04 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1668  plasmid stabilization system  34.09 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0457  plasmid stabilization system  30.53 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4865  hypothetical protein  28.87 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0570  plasmid stabilization system  29.9 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  30.68 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3239  plasmid stabilization system protein  30.95 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.38 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3224  hypothetical protein  25 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000593957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2585  plasmid stabilization system  32.61 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0332176  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3457  plasmid stabilization system  28.89 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1024  plasmid stabilization system  26.74 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1930  plasmid stabilization system  25 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143726  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2186  plasmid stabilization system protein  29.79 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4230  plasmid stabilization system protein  33.7 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.387764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>