More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0594 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0243  MFS permease  95.4 
 
 		 435 aa  809    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0594  general substrate transporter  100 
 
 		 441 aa  859    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2029  major facilitator superfamily permease  80.89 
 
 		 436 aa  665    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1509  general substrate transporter  69.47 
 
 		 442 aa  542  1e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.386131 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5984  General substrate transporter  60.83 
 
 		 443 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4373  general substrate transporter  60.37 
 
 		 446 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1745  putative membrane transport protein  61.86 
 
 		 446 aa  501  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4045  General substrate transporter  59.91 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.849183  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7134  General substrate transporter  60.37 
 
 		 443 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409083 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5109  major facilitator transporter  60.61 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4779  General substrate transporter  61.89 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0207001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5736  general substrate transporter  59.42 
 
 		 447 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5607  major facilitator protein family permease  58.7 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.361176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4338  putative transmembrane transporter protein  58.85 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4707  putative transmembrane transporter protein  58.85 
 
 		 444 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1549  General substrate transporter  57.49 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310202  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1730  general substrate transporter  54.82 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366529  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4855  General substrate transporter  57.11 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1878  major facilitator superfamily MFS_1  57.97 
 
 		 439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.232309 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4056  major facilitator transporter  55.61 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.713294  normal  0.178952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2224  major facilitator superfamily transporter  54.82 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199134  hitchhiker  0.000423669 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4889  general substrate transporter  56.53 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.321376  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2264  General substrate transporter  56.64 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.176336  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2774  general substrate transporter  56.88 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.835468 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2283  putative transport protein  42.55 
 
 		 418 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.06 
 
 		 436 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  39.86 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  38.82 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  39.52 
 
 		 445 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  34.96 
 
 		 470 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.41 
 
 		 447 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  39.22 
 
 		 426 aa  253  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  35.23 
 
 		 470 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  35.14 
 
 		 466 aa  248  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  36.63 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  36.63 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  36.63 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 452 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.78 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  37.5 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  35.68 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 628 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.25 
 
 		 440 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 436 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.78 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  35.93 
 
 		 489 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.97 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.93 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  35.93 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.37 
 
 		 442 aa  217  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.54 
 
 		 441 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  35.61 
 
 		 523 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  35.7 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  32.3 
 
 		 482 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  35.7 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  35.7 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  36.52 
 
 		 393 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  34.87 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  35.71 
 
 		 506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  34.86 
 
 		 437 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  35.21 
 
 		 435 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  34.71 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  34.92 
 
 		 483 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  34.48 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 442 aa  209  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  30.68 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.12 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.79 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  33.63 
 
 		 472 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  34.17 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.24 
 
 		 438 aa  206  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 435 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 420 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  33.99 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 		 420 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.51 
 
 		 441 aa  202  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  33.18 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  33.79 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  35.58 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  35.58 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.31 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.36 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.36 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  35.31 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.36 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.36 
 
 		 440 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 441 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.41 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  35.41 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  34.86 
 
 		 433 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.13 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.13 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  35.41 
 
 		 440 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>