208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3375 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3375  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4763  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  53.28 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0519  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 238 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3900  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.32 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3274  cyclic nucleotide-binding  48 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00132125 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3744  cyclic nucleotide-binding protein  42.54 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2150  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  48.18 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0697428  normal  0.281717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3742  cyclic nucleotide-binding protein  41.52 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1637  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.55 
 
 		 232 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0811489  hitchhiker  0.00000101787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1232  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2740  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00150781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2723  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1693  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.3052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4421  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1684  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5104  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5755  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5274  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5585  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1519  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0520  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0542  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.936935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3898  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4411  cyclic nucleotide-binding protein  36.32 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5290  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420985  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5568  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1647  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.362036  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3820  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.89 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1444  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4412  cyclic nucleotide-binding protein  38.16 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1115  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.804671  normal  0.524469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1315  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.63413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2386  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 268 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.799782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2702  cyclic nucleotide-binding protein  37.12 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0177  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2043  cyclic nucleotide-binding  37.72 
 
 		 439 aa  144  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.4 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.157616 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0397  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.934312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4275  cyclic nucleotide-binding protein  34.4 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1182  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.87 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2533  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.81 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6495  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.956501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1130  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 267 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.440884 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2260  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.43 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5358  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0511998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1680  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 340 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5590  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 242 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4415  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5269  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 340 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1963  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.555453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.81 
 
 		 246 aa  136  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3729  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 244 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3627  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  35.87 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  35.87 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1448  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 269 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.957897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5841  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1390  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.98 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3818  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.91 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3626  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.468145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2537  transcriptional regulator-related protein  34.08 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.656483  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3898  regulatory protein Crp  36.44 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4266  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.44 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.522306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1316  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.45 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3549  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.27 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0905  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.68 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1834  cyclic nucleotide-binding protein  37.05 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4369  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.56 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.324927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0876  transcriptional regulator-related protein  32.29 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4396  cyclic nucleotide-binding protein  35.56 
 
 		 242 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1916  cyclic nucleotide-binding  34.67 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4409  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2550  transcriptional regulator-related protein  34.74 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0178  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.05 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1802  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4150  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 260 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0712018  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3301  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 260 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.228531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4216  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 260 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.317081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2036  Crp/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.411103  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3639  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1787  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.22283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1803  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  35.05 
 
 		 260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0831  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.58 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.104237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4113  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0173  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.53 
 
 		 263 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6180  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191736  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  35.05 
 
 		 260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  35.05 
 
 		 260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  35.05 
 
 		 260 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4389  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0534  hypothetical protein  32.62 
 
 		 344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5538  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.13336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1833  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0645  hypothetical protein  33.76 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0659  hypothetical protein  33.76 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>