More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0649 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  79.17 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  81.16 
 
 		 107 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  73.61 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  73.61 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  73.61 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  71.43 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  65.22 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  61.11 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  62.5 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  66.67 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  63.77 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  63.77 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  62.86 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  60.87 
 
 		 117 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  61.76 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  60.29 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  57.97 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  57.97 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  60.29 
 
 		 114 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  56.52 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  56.52 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  56.52 
 
 		 118 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  55.56 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  60 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  55.71 
 
 		 118 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  56.52 
 
 		 117 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4960  putative insertion sequence transposase protein  58.73 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  51.39 
 
 		 117 aa  84.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  51.39 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  59.09 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  50 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  50 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6182  IS66 Orf2 like  59.09 
 
 		 116 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  60 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0065  transposase  49.23 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  56.06 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  52.86 
 
 		 116 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  49.3 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  59.42 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  59.42 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  59.42 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  59.42 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  57.58 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  57.58 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  49.3 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2621  IS66 Orf2 family protein  48.53 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0157656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2651  IS66 Orf2 family protein  48.53 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2629  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2633  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2664  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.553305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  52.86 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  52.86 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0643  IS66 Orf2 family protein  41.1 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.237519  normal  0.0166652 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0928  IS66 Orf2 family protein  41.1 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0189204  normal  0.805776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  52.86 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  52.86 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  52.86 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  52.86 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  52.86 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  54.69 
 
 		 97 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  50 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0320  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000227247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0323  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0475  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0129202  normal  0.393615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0661  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00198496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0678  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000411933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1791  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163942  normal  0.445936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1975  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00703448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2185  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000012204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2191  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3293  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000889246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  53.85 
 
 		 116 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  47.06 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  55.74 
 
 		 62 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  53.62 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  53.62 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  48.57 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  47.06 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0274  IS66 Orf2 family protein  46.05 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0282  IS66 Orf2 family protein  46.05 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  50.77 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  50.77 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  50.77 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  50.77 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  48.57 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  48.57 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  50.77 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  47.06 
 
 		 117 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0366  IS66 Orf2 family protein  50.77 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>