More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6378 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  100 
 
 
116 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6182  IS66 Orf2 like  79.13 
 
 
116 aa  193  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  73.28 
 
 
116 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  70.69 
 
 
116 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1411  IS66 Orf2 family protein  68.97 
 
 
116 aa  171  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3091  IS66 Orf2 family protein  68.97 
 
 
116 aa  171  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292873  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  67.52 
 
 
117 aa  164  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2522  IS66 Orf2 family protein  70.94 
 
 
117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0155  hypothetical protein  64.66 
 
 
116 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4533  IS66 Orf2 family protein  68.38 
 
 
117 aa  157  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  62.39 
 
 
117 aa  150  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7465  IS66 Orf2 family protein  60.68 
 
 
117 aa  150  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  62.07 
 
 
149 aa  149  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0079  hypothetical protein  61.54 
 
 
117 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2549  putative IS66 transposase, TnpB  61.54 
 
 
117 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144737  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3737  putative transposase  61.54 
 
 
117 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  62.39 
 
 
117 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4918  IS66 Orf2 family protein  57.26 
 
 
117 aa  143  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1728  transposase  59.29 
 
 
117 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7616  IS66 Orf2 family protein  56.41 
 
 
117 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337791  normal  0.745355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  57.26 
 
 
137 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0065  transposase  52.29 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  50.85 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  50.85 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1004  IS66 Orf2 family protein  54.21 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1617  IS66 Orf2 family protein  54.21 
 
 
119 aa  115  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.841823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1275  IS66 Orf2 like  52.73 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0748558  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0320  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000227247  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0323  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000316141  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0475  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0129202  normal  0.393615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0661  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00198496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0678  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000411933  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1791  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163942  normal  0.445936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1975  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00703448  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2185  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000012204  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2191  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378167  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3293  IS66 Orf2 family protein  54 
 
 
119 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000889246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2621  IS66 Orf2 family protein  48.7 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0157656  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2651  IS66 Orf2 family protein  48.7 
 
 
119 aa  104  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110169  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2629  IS66 Orf2 family protein  53 
 
 
119 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396747  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2633  IS66 Orf2 family protein  53 
 
 
119 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2664  IS66 Orf2 family protein  53 
 
 
119 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.553305  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2162  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1671  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0737261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1834  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0015  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.461539  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1929  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.721317  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1362  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0896  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0515  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0143  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1279  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1715  transposase  54.26 
 
 
115 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1663  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0780346  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1416  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0069  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1944  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0316  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0165455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1206  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0904  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0290  transposase  54.26 
 
 
115 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1292  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.035818  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2115  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1257  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1779  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.076301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2010  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1746  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1655  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0420021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1575  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2952  transposase  54.26 
 
 
115 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0235  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.800735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0215  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1810  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0114  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0782  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0436  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0280  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2485  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991147  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0810  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1240  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1062  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0999  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2461  transposase  54.26 
 
 
115 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2249  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327358  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2488  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2760  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2808  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2708  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2261  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2881  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2043  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2087  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2405  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2752  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2731  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2179  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2685  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2599  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2942  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2934  transposase  54.26 
 
 
115 aa  103  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>