More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8230 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8230  transposase  100 
 
 		 117 aa  239  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  100 
 
 		 117 aa  239  9e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  95.73 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  94.02 
 
 		 117 aa  229  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  80.17 
 
 		 117 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  85.14 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  55.17 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  50.43 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  51.3 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  56.41 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  56.41 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  51.69 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  51.69 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  51.69 
 
 		 118 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  52.94 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  52.29 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  52.83 
 
 		 107 aa  119  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  45.3 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  50.52 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  88.14 
 
 		 62 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  44.35 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  46.15 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  49.12 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  49.12 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  40.87 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  40.87 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  42.59 
 
 		 118 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  42.61 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  42.61 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  42.61 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  42.61 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  43.97 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  45.19 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  43.1 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  43.1 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  43.1 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  43.1 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  43.1 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  42.74 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  43.1 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  43.97 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  44.23 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3710  IS66 Orf2 family protein  40.78 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  42.24 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  42.31 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  42.31 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  42.31 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  43.1 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  41.35 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  41.67 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  39.32 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  42.31 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  42.31 
 
 		 115 aa  90.5  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  40.95 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  45.16 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  45.16 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  45.16 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  45.16 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  45.16 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  45.16 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  38.46 
 
 		 114 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  41.88 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  41.88 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  42.27 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  45.26 
 
 		 115 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  42.59 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  42.06 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  43.62 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  40.35 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  40.35 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  40.35 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  44.23 
 
 		 113 aa  85.5  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  40.35 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  39.32 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  38.46 
 
 		 115 aa  84.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0398  IS66 Orf2 like  42.31 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4156  transposase, IS66 Orf2  44.71 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  40.17 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  40.17 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  43.43 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  43.43 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  43.43 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2417  IS66 Orf2 family protein  49.33 
 
 		 101 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  41.03 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  50 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0258  hypothetical protein  45.26 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0620314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  45.45 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  45.45 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  44.94 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  45.45 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>