More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0692 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0692  transposase  100 
 
 		 117 aa  242  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  94.87 
 
 		 117 aa  236  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  97.96 
 
 		 107 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  66.67 
 
 		 117 aa  174  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  55.56 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  61.95 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  59.65 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  59.65 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  59.65 
 
 		 118 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  61.32 
 
 		 118 aa  145  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  60.19 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  52.17 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  52.17 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  51.3 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  51.3 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  53.1 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  53.1 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  53.1 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  50.88 
 
 		 117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  48.28 
 
 		 117 aa  123  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  53.33 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  50.88 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  51.33 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  47.83 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  52.78 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  52.78 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  52.78 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  52.78 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  49.52 
 
 		 106 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  47.27 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  50.94 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  50.94 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  48.08 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  48.08 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  48.08 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  48.08 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  63.89 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  60 
 
 		 118 aa  103  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  46.15 
 
 		 115 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  45.13 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  44.23 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  44.23 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  44.23 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  40 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  47.12 
 
 		 115 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  41.74 
 
 		 115 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  43.75 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  43.27 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  43.75 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  43.75 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  43.75 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  43.75 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  43.75 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 		 115 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  39.13 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  39.13 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  39.13 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  39.13 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  39.13 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  43.93 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  43.93 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6198  IS66 Orf2 family protein  49.35 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  44.55 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  38.26 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  40 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  40 
 
 		 115 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3168  putative IS66 transposase orf2, TnpB  40.37 
 
 		 116 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589585  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  46.51 
 
 		 97 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  42.16 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3710  IS66 Orf2 family protein  44 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  43.86 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  39.42 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  44.66 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  43.75 
 
 		 113 aa  90.1  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2539  IS66 Orf2 family protein  43.1 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3925  IS66 Orf2 family protein  41.38 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3332  IS66 Orf2 family protein  41.38 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0027  IS66 Orf2 family protein  43.1 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3965  IS66 Orf2 family protein  41.38 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  43.69 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  43.69 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  42.72 
 
 		 115 aa  88.6  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  40.4 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  42.48 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  40.4 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  40.4 
 
 		 108 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  40.59 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3677  IS66 Orf2 family protein  42.06 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0516  IS66 Orf2 like  40 
 
 		 118 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000107243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2122  IS66 family orf2  37.5 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  62.3 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>