More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3505 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  89.83 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  88.14 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  88.14 
 
 		 117 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  88.14 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  86.89 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  63.93 
 
 		 117 aa  87.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  62.3 
 
 		 107 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  60.66 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  62.3 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  68.33 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  66.67 
 
 		 117 aa  84.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  66.67 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  61.67 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  60 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1416  IS66 Orf2 family protein  67.86 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  54.1 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  59.02 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  59.02 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  59.02 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  59.02 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  55.74 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  53.33 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  55.74 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  55.74 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  51.67 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  51.67 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  51.67 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  51.67 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  51.67 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  51.67 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  51.67 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  47.54 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  49.18 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  49.18 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  49.18 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0027  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2539  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  53.33 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4918  IS66 Orf2 family protein  48.21 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3965  IS66 Orf2 family protein  48.33 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3925  IS66 Orf2 family protein  48.33 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3332  IS66 Orf2 family protein  48.33 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  50.82 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  50.82 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  50.82 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  50.82 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3677  IS66 Orf2 family protein  45.9 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0471  putative IS66 Orf2  48.33 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  49.09 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  46.43 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  47.54 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  46.43 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  46.43 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  49.09 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  50.91 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  49.09 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  49.09 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  49.09 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  49.09 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  49.09 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  49.09 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  49.09 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  49.09 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  49.09 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  49.09 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4315  IS66 Orf2 family protein  48.21 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4960  putative insertion sequence transposase protein  50.91 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6442  IS66 Orf2 family protein  46.67 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000390412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  50 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1062  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0794003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1279  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.507833  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0904  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0896  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0316  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0165455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1206  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0290  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1292  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.035818  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0782  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00298688  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1810  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0810  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1575  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1655  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0420021  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1671  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0737261  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0515  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1779  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.076301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0999  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1240  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1257  transposase  49.09 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>