More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1416 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1416  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
84 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  98.51 
 
 
117 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  95.52 
 
 
117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  56.72 
 
 
118 aa  84  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  53.73 
 
 
117 aa  83.6  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  51.22 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  51.22 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  51.22 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  59.7 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  52.24 
 
 
118 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  51.52 
 
 
117 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  67.86 
 
 
62 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  59.7 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  67.86 
 
 
118 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  48.48 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  55.36 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  59.09 
 
 
117 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  56.67 
 
 
128 aa  77  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  56.67 
 
 
128 aa  77  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  58.21 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  58.21 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
117 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  55.17 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  56.36 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  44.62 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  44.62 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  44.62 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  47.76 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  46.15 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  45.9 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  46.38 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0274  IS66 Orf2 family protein  40.91 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0282  IS66 Orf2 family protein  40.91 
 
 
119 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5561  IS66 Orf2 family protein  48.33 
 
 
113 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.440341 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  46.27 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  46.27 
 
 
115 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0366  IS66 Orf2 family protein  40.91 
 
 
119 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4960  putative insertion sequence transposase protein  43.48 
 
 
162 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00139484  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
115 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  44.78 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2539  IS66 Orf2 family protein  44.07 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0027  IS66 Orf2 family protein  44.07 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  48.28 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  48.28 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  48.28 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  48.28 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  46.97 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  46.15 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6182  IS66 Orf2 like  42.62 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  42.62 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  43.28 
 
 
115 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  45.45 
 
 
115 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6442  IS66 Orf2 family protein  45.45 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000390412 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  45.45 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  45.45 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  45.45 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  45 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0471  putative IS66 Orf2  46.77 
 
 
75 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3925  IS66 Orf2 family protein  42.37 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3332  IS66 Orf2 family protein  42.37 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3965  IS66 Orf2 family protein  42.37 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  44.78 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  44.78 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  44.78 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  44.78 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3677  IS66 Orf2 family protein  40.68 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  44.78 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  44.78 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  39.34 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  40.98 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  40.98 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  40.98 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  40.98 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  36.92 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  43.33 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  37.88 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  37.88 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2629  IS66 Orf2 family protein  41.67 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396747  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2633  IS66 Orf2 family protein  41.67 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00180347  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2664  IS66 Orf2 family protein  41.67 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.553305  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  43.94 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>