More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0936 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  86.49 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  85.14 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  85.14 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  83.78 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  82.43 
 
 		 117 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  58.67 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  60 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  60 
 
 		 117 aa  103  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  60.81 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  66.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  64.86 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  61.33 
 
 		 118 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  56 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  64.86 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  60 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  60 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  60 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  54.05 
 
 		 107 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  58.11 
 
 		 117 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  56.76 
 
 		 106 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  55.71 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  52.7 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  52.7 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  51.35 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  51.35 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  51.35 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  48 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  52.7 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  52.7 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  52.7 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  52.7 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1416  IS66 Orf2 family protein  67.86 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  48.65 
 
 		 115 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  52.7 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5561  IS66 Orf2 family protein  51.35 
 
 		 113 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.440341 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  48.65 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  48.65 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  48.65 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  50 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  48.65 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  48.65 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  48.65 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  48.65 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  48.65 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3677  IS66 Orf2 family protein  44.32 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  48.65 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4960  putative insertion sequence transposase protein  42.16 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6442  IS66 Orf2 family protein  47.3 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000390412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  47.76 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  45.71 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2539  IS66 Orf2 family protein  48.57 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  48.65 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  49.3 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  52.11 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0027  IS66 Orf2 family protein  48.57 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  47.3 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3710  IS66 Orf2 family protein  44.59 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3925  IS66 Orf2 family protein  47.14 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3332  IS66 Orf2 family protein  47.14 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3965  IS66 Orf2 family protein  47.14 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4918  IS66 Orf2 family protein  48.44 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  50.77 
 
 		 116 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  48.53 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  45.95 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  52.94 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6578  IS66 Orf2 family protein  48.44 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.0329516 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  48.44 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  45.95 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  47.3 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  47.3 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  52.94 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  52.94 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  52.94 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  52.94 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  52.94 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  44.29 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  44.59 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  45.95 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  45.95 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>