More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3721 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  99.15 
 
 
117 aa  234  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  96.58 
 
 
117 aa  233  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1416  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
84 aa  138  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  63.3 
 
 
117 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  58.97 
 
 
117 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  55.08 
 
 
118 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  55.93 
 
 
118 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  55.93 
 
 
118 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  55.93 
 
 
118 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  52.59 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  58.12 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  57.26 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  57.26 
 
 
117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  55.26 
 
 
118 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  54.37 
 
 
107 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  50.88 
 
 
117 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  48.67 
 
 
117 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  48.25 
 
 
117 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2402  IS66 Orf2 family protein  87.14 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.490306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  50.49 
 
 
106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  47.01 
 
 
117 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  46.43 
 
 
118 aa  106  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  46.43 
 
 
118 aa  106  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  46.43 
 
 
118 aa  106  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  48.62 
 
 
115 aa  105  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  51.46 
 
 
115 aa  102  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  51.46 
 
 
115 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  51.46 
 
 
115 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  66.22 
 
 
118 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  50 
 
 
128 aa  100  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  50 
 
 
128 aa  100  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  46.85 
 
 
115 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  49.51 
 
 
120 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  41.38 
 
 
114 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  45.37 
 
 
115 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  44.44 
 
 
115 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  48.54 
 
 
115 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  48.54 
 
 
115 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  48.54 
 
 
115 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  44.44 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  44.44 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  47.57 
 
 
115 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  44.44 
 
 
114 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  47.52 
 
 
115 aa  97.4  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  45.87 
 
 
115 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  45.87 
 
 
115 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  44.55 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  46.88 
 
 
115 aa  96.7  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  47.92 
 
 
115 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  44.25 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  44.25 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  44.25 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  44.25 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  44.25 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  44.25 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  43.36 
 
 
115 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3710  IS66 Orf2 family protein  47.57 
 
 
113 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173812  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  45.45 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  45.45 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  46.88 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  46.88 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  46.88 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  46.88 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  46.88 
 
 
115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  46.88 
 
 
115 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  46.88 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  45.83 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  44.64 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3595  IS66 Orf2 family protein  45.45 
 
 
115 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428006  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  46.88 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  42.73 
 
 
116 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  43.12 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5561  IS66 Orf2 family protein  46.96 
 
 
113 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.440341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3168  putative IS66 transposase orf2, TnpB  45.83 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589585  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5014  IS66 Orf2 family protein  46.6 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  57.97 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  42.86 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  42.86 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  44.66 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  42.86 
 
 
117 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2253  IS66 Orf2 family protein  47.57 
 
 
115 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556164  hitchhiker  0.00787404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>