More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1327 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 
115 aa  231  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  98.26 
 
 
115 aa  228  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  97.39 
 
 
115 aa  227  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  97.39 
 
 
115 aa  227  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  97.39 
 
 
115 aa  227  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  97.39 
 
 
115 aa  227  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  97.39 
 
 
115 aa  227  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  55.56 
 
 
115 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  55.14 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  52.78 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  56.07 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  54.21 
 
 
115 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  54.21 
 
 
115 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  54.21 
 
 
115 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  54.21 
 
 
115 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  54.21 
 
 
115 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  52.83 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6442  IS66 Orf2 family protein  60.64 
 
 
101 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000390412 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  55.14 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  55.14 
 
 
115 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  53.27 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  57.58 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  54.37 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  54.37 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3168  putative IS66 transposase orf2, TnpB  53.27 
 
 
116 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589585  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4975  IS66 Orf2 like  53.54 
 
 
117 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000117762  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  50 
 
 
115 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  49.07 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  49.07 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  49.07 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  49.07 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  49.07 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  49.07 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2590  putative transposase, TnpB  52.53 
 
 
114 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0258  hypothetical protein  50.51 
 
 
114 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0620314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  50.48 
 
 
115 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  50.48 
 
 
115 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790251  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  50.48 
 
 
115 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0227  IS66 family element, orf2  50.48 
 
 
115 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  50.48 
 
 
115 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  45.37 
 
 
117 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  47.66 
 
 
117 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  52.69 
 
 
117 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1654  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2414  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.175278  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2363  ISEc8 transposase  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000786413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2602  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2619  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2963  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.532183  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1116  ISEc8 transposase  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0194  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1114  ISEc8 transposase  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.883622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4638  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0708  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  49.04 
 
 
118 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1002  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1583  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3447  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3414  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3676  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1641  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2637  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0018  ISEc8 transposase  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4659  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.542564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4653  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1867  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3097  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00401392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2712  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.844413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0511  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3709  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000797988  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0711  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.669363  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1005  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0145  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8625  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4624  ISEc8 transposase  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2948  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
118 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
118 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
118 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3385  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1650  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0117  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.780843  normal  0.658153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  51.52 
 
 
115 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>