More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1111 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  243  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  76.27 
 
 		 118 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  76.27 
 
 		 118 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  76.27 
 
 		 118 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  72.81 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  71.96 
 
 		 107 aa  166  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  57.26 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  55.56 
 
 		 117 aa  151  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  55.26 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  56.25 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  50.85 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  58.76 
 
 		 107 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  56.14 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  53.57 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  55.26 
 
 		 117 aa  129  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  54.29 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  58.25 
 
 		 106 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  54.39 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  54.63 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  53.92 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  79.17 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  56.31 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  53.7 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  53.7 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  56.73 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  56.73 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  55 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  52.94 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  52.94 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  54.37 
 
 		 115 aa  120  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  54.81 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  53.85 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  53.64 
 
 		 115 aa  117  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  52.88 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  53.4 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  53.4 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  52.88 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  52.88 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  52.88 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  51.92 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  53.27 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  53.27 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  53.27 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  53.27 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  54.55 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  54.55 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  47.12 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  50.96 
 
 		 115 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  48.15 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  49 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  50 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  50 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  50 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  50 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  50 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  53.49 
 
 		 97 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  49.04 
 
 		 115 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  49.04 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  49.04 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  48.08 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  48.08 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  46.96 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  48.51 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  45.63 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  45.63 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  45.63 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  45.63 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  45.63 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  45.63 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  45.63 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  48.54 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6198  IS66 Orf2 family protein  57.32 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  47.57 
 
 		 115 aa  104  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  48 
 
 		 113 aa  103  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  45.63 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  50.51 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  50.51 
 
 		 108 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  50.51 
 
 		 128 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1645  IS66 family element, orf2  42.45 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1338  IS66 family element, orf2  39.45 
 
 		 116 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1524  IS66 family element, orf2  42.45 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3168  putative IS66 transposase orf2, TnpB  47.92 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589585  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  47.52 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4196  IS66 family element, orf2  42.45 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1607  ISEc8 transposase  42.45 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790251  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  47.52 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0227  IS66 family element, orf2  42.45 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  56 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  47.52 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  47.52 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>