More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1224 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  100 
 
 		 106 aa  213  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  99.06 
 
 		 117 aa  212  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  58.25 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  61.05 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  56.73 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  51.43 
 
 		 117 aa  120  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  54.72 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  54.72 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  54.72 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  52.94 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  50.49 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  50.49 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  49.52 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  49.51 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  48.08 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  48.08 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  48.04 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  46.15 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  46.15 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  50.49 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  46.6 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  51.72 
 
 		 107 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  45.63 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  45.63 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  48.04 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  48.04 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  48.04 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  48.04 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  48.11 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  48.11 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  60.29 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0936  IS66 Orf2 family protein  56.76 
 
 		 118 aa  90.5  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.13199  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6198  IS66 Orf2 family protein  49.37 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  43.01 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  43.01 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  43.01 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  43.01 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  43.01 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  41.94 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  46.39 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  45.54 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  42.57 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  42.57 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  41.51 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  41.94 
 
 		 115 aa  80.5  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3505  hypothetical protein  60 
 
 		 62 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.151304  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  40 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  40 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  43.96 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  40 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  40 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  39.05 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3710  IS66 Orf2 family protein  40.66 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  45.05 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  42.11 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  39.78 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  39.78 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6378  IS66 Orf2 like  47.06 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3408  IS66 family transposase  40.66 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  39.78 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7044  transposase  40.66 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.223863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0687  transposase  40.66 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  41.76 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  41.76 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9096  transposition-related protein  40.66 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  42.86 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3332  IS66 Orf2 family protein  36.79 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  40.23 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3925  IS66 Orf2 family protein  36.79 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3965  IS66 Orf2 family protein  36.79 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4918  IS66 Orf2 family protein  40.2 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3677  IS66 Orf2 family protein  38.38 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  41.76 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1535  IS66 Orf2 family protein  36.26 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1784  IS66 Orf2 family protein  36.26 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  39.6 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2253  IS66 Orf2 family protein  41.76 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0556164  hitchhiker  0.00787404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  41.76 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  41.76 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  41.76 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  41.76 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2539  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  41.86 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  37.93 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1416  IS66 Orf2 family protein  56.36 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0027  IS66 Orf2 family protein  37.5 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>