More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0557 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  100 
 
 
128 aa  256  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  100 
 
 
128 aa  256  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  57.39 
 
 
117 aa  150  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  56.76 
 
 
118 aa  147  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  55.86 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  55.86 
 
 
118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  57.39 
 
 
118 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  57.39 
 
 
118 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  57.39 
 
 
118 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  57.41 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  57.41 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  57.41 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  57.41 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  54.55 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  57 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  53.27 
 
 
117 aa  122  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  55.21 
 
 
107 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  50.94 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  48.11 
 
 
117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  50 
 
 
117 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  49.12 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  49.12 
 
 
117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  50.91 
 
 
117 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  48.25 
 
 
117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  48.67 
 
 
114 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  49.02 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  47.32 
 
 
117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  48.18 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  49.06 
 
 
117 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  48.11 
 
 
106 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 
107 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  46.23 
 
 
115 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  42.74 
 
 
115 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  43.1 
 
 
115 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  41.12 
 
 
115 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  43.59 
 
 
115 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  43.59 
 
 
115 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  41.88 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  41.88 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  41.88 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  41.88 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  41.88 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  45.05 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  46.32 
 
 
97 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  41.51 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  41.03 
 
 
115 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  47 
 
 
115 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  63.77 
 
 
131 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  42.59 
 
 
120 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  47 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  47 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  47 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  47 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  47 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  47 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4745  IS66 Orf2 family protein  36.94 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1338  IS66 family element, orf2  46.08 
 
 
116 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2122  IS66 family orf2  46.08 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3136  IS66 family transposase orfB  46.08 
 
 
116 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  36.61 
 
 
117 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  35.9 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6839  IS66 Orf2 family protein  39.64 
 
 
116 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  44.04 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  43.24 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  39.62 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  39.62 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  39.62 
 
 
115 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  44.04 
 
 
108 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  44.04 
 
 
108 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0258  hypothetical protein  43.59 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0620314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4294  IS66 family element, orf2  45.1 
 
 
116 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  38.68 
 
 
115 aa  93.2  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6182  IS66 Orf2 like  45.19 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3898  IS66 family transposase orfB  44.12 
 
 
116 aa  93.2  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2539  IS66 Orf2 family protein  40.68 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0027  IS66 Orf2 family protein  40.68 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  36.7 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3332  IS66 Orf2 family protein  43.12 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3965  IS66 Orf2 family protein  43.12 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3925  IS66 Orf2 family protein  43.12 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  42.16 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  42.16 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  45.36 
 
 
113 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6339  IS66 Orf2 family protein  35.71 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.191496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2590  putative transposase, TnpB  40.17 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3091  IS66 Orf2 family protein  39.32 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292873  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1411  IS66 Orf2 family protein  39.32 
 
 
116 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6198  IS66 Orf2 family protein  48.78 
 
 
90 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  40.38 
 
 
115 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>