More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6365 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  89.83 
 
 		 118 aa  224  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  89.83 
 
 		 118 aa  224  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  89.83 
 
 		 118 aa  224  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  59.32 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  51.75 
 
 		 117 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  57.41 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  57.41 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  52.78 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  51.85 
 
 		 117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  53.27 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  51.26 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  48.74 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  48.74 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  48.74 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  53.68 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  54.84 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  43.48 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  45.45 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  47.66 
 
 		 117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  43.48 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  42.61 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  42.61 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  47.71 
 
 		 117 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  44.95 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  44.04 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  48.04 
 
 		 106 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  45.63 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  43.36 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  43.75 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  42.74 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  44.44 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  44.44 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  42.48 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  44.44 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  43.59 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  43.59 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  43.59 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  43.59 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  43.59 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  44.44 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  39.82 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  39.42 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  39.42 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  39.42 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  39.42 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  39.42 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  39.42 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  39.42 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  43.81 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  43.81 
 
 		 115 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  59.42 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  36.28 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  43.88 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  43.88 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  43.88 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  42.37 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  43.88 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  43.88 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  43.88 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  41.28 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  44.66 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4906  IS66 Orf2 family protein  40.71 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  40.18 
 
 		 115 aa  90.1  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0785  IS66 Orf2 family protein  40.71 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1182  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1813  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.376504  hitchhiker  0.0000000512452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2932  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2840  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0343  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000139365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1406  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5042  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1309  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1761  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3344  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  40.91 
 
 		 115 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0020  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0069  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0039  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4861  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4878  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0816  IS66 family orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3875  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4291  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2223  IS66 family element, orf2  40.78 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0126387  hitchhiker  0.00000000000242445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0027  IS66 Orf2 family protein  36.84 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2539  IS66 Orf2 family protein  36.84 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>