More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8373 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4340  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6321  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8373  IS66 Orf2 family protein  100 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1473  IS66 Orf2 family protein  82.2 
 
 		 118 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1111  IS66 Orf2 family protein  76.27 
 
 		 118 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4597  IS66 Orf2 family protein  74.53 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4651  IS66 Orf2 family protein  57.76 
 
 		 117 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0650066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0692  transposase  59.65 
 
 		 117 aa  149  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4166  transposase IS66  56.78 
 
 		 117 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0244741  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4876  IS66 Orf2 family protein  61.86 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441655  normal  0.549827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0170  IS66 Orf2 family protein  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0432  IS66 Orf2 family protein  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0916  IS66 Orf2 family protein  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.970798  normal  0.23963 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1418  IS66 Orf2 family protein  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1808  IS66 Orf2 family protein  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.162675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3517  hypothetical protein  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.767717 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3716  hypothetical protein  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3721  transposase IS66  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3762  transposase IS66  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4309  hypothetical protein  55.93 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3308  IS66 Orf2 family protein  53.85 
 
 		 117 aa  133  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5409  IS66 Orf2 family protein  52.54 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.632705 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3725  hypothetical protein  57.26 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4781  IS66 Orf2 family protein  58.26 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.354351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4304  hypothetical protein  55.08 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.758008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0658  IS66 Orf2 family protein  53.39 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0557  IS66 family orf2  57.39 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212885  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9622  transposase  52.54 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0184  IS66 family element, orf2  51.28 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0523  IS66 family element, orf2  57.39 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2743  IS66 Orf2 family protein  50.94 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8230  transposase  51.69 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.954205  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8248  transposase  51.69 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4687  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4327  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1224  putative transposase  54.72 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.536263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6512  IS66 Orf2 family protein  57.69 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0986817 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6487  IS66 Orf2 family protein  57.69 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  0.529446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0664  IS66 Orf2 family protein  54.55 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8237  transposase  54.24 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5536  IS66 Orf2 like  59.62 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0649  IS66 Orf2 like  73.61 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2725  IS66 Orf2 family protein  53.51 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3777  putative transposase  52.63 
 
 		 115 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0067  IS66 Orf2 family protein  54.81 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0727  IS66 Orf2 family protein  52.88 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.152031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5515  IS66 Orf2 family protein  48.74 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1221  IS66 Orf2 family protein  48.74 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246885  normal  0.0452549 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6365  IS66 Orf2 family protein  48.74 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6098  IS66 Orf2 family protein  48.74 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2736  TnpB protein  52.88 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0849052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0899  IS66 Orf2 family protein  51.92 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.424933  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4787  IS66 Orf2 family protein  51.92 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2729  IS66 Orf2 family protein  51.92 
 
 		 115 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.767344  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0710  IS66 Orf2 family protein  50.96 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1440  TnpB protein  51.92 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1448  TnpB protein  51.92 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0340857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1451  TnpB protein  51.92 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2689  TnpB protein  51.92 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.537031  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3141  TnpB protein  51.92 
 
 		 115 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.876573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0341  IS66 Orf2 like  55.81 
 
 		 97 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.20024  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1177  70 kDa peroxisomal membrane protein  50.96 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.664227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2996  IS66 Orf2 like  50 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.372454  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2812  TnpB protein  50.96 
 
 		 115 aa  105  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5387  IS66 Orf2 family protein  49.56 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.936654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1446  TnpB protein  50.96 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0324293  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6858  IS66 Orf2 family protein  51.92 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.70901  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4916  IS66 Orf2 family protein  44.07 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.256223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0610  hypothetical protein  50.49 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6362  hypothetical protein  50.49 
 
 		 115 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.251607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6727  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.523617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2792  IS66 Orf2 like  50 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0836026  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5079  IS66 Orf2 family protein  47.52 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4609  IS66 Orf2 family protein  47.22 
 
 		 115 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225742  normal  0.160384 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0035  IS66 family element, Orf2 protein  48.51 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0046  IS66 family orf2  48.51 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916394  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0064  IS66 family orf2  48.51 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719086  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0004  IS66 family orf2  48.51 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3367  IS66 family orf2  48.51 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.555204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4880  IS66 family orf2  48.51 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1758  IS66 family orf2  48.51 
 
 		 115 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0400998  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3710  IS66 Orf2 family protein  49.12 
 
 		 113 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1327  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  100  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0268253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1102  TnpB protein  47.46 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0327044  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3807  IS66 Orf2 like  47.52 
 
 		 117 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2890  TnpB protein  52.53 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3090  TnpB protein  52.53 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1755  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.861683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2938  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2469  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0949721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2092  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1708  ISAfe4, transposase orf2  50 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0267  IS66 Orf2 family protein  50 
 
 		 115 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.778884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6338  IS66 Orf2 like  45.45 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2590  putative transposase, TnpB  47.71 
 
 		 114 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3168  putative IS66 transposase orf2, TnpB  51.49 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.589585  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4819  IS66 Orf2 family protein  45.61 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.115753 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4816  IS66 Orf2 family protein  45.61 
 
 		 115 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.191561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2549  putative IS66 transposase, TnpB  42.57 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3737  putative transposase  42.57 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>