33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0187 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0187  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  256  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0182  hypothetical protein  71.97 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0276  hypothetical protein  73.48 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.440842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0546  hypothetical protein  72.73 
 
 		 133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00496628  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4119  hypothetical protein  48.39 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1921  hypothetical protein  51.61 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0935  hypothetical protein  50.96 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2146  inner membrane protein  41.23 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0501  inner membrane protein  36.15 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1222  hypothetical protein  40.31 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.406999  normal  0.0415126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04774  inner membrane protein  37.98 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2214  hypothetical protein  36.92 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.843648  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  39 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  39 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2885  hypothetical protein  35.38 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.241636  normal  0.197361 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  31.9 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0887  hypothetical protein  33.04 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2571  putative transmembrane protein  31.62 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0175942  hitchhiker  0.0000688239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0523  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0835  inner membrane protein  31.9 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.149897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2145  inner membrane protein  29.51 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  31.4 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1672  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.50162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3507  inner membrane protein  27.2 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.540639  normal  0.399207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  33.05 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0552  inner membrane protein  32.48 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.642383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  30.58 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  31.37 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  33.03 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  32.61 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  32.26 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  31.87 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>