138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4143 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  79.22 
 
 
231 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  73.59 
 
 
231 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  73.36 
 
 
229 aa  348  6e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.03 
 
 
238 aa  268  8e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  48.28 
 
 
232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.35 
 
 
232 aa  231  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  54.46 
 
 
229 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  50.67 
 
 
236 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  49.29 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.34 
 
 
229 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  48 
 
 
229 aa  214  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  45.99 
 
 
236 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  45.33 
 
 
229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  45.62 
 
 
229 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.29 
 
 
232 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  36.65 
 
 
222 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  36.67 
 
 
237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  34.35 
 
 
279 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  40.85 
 
 
230 aa  131  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.89 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  27.7 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  28.72 
 
 
263 aa  59.3  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  26.39 
 
 
268 aa  58.5  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  34.82 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  36.8 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  37.11 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.7 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  26.6 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  26.6 
 
 
263 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  26.6 
 
 
263 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  38 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  38.33 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  28.73 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.89 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  37.5 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  32.69 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  28.95 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.16 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  29.37 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  23.68 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  34.07 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.37 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.87 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  27.37 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  27.36 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  37.11 
 
 
228 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  29.02 
 
 
312 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.11 
 
 
228 aa  52.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  32.11 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  24.54 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  37.63 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  31.41 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  30.56 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.78 
 
 
267 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  28.67 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1744  Glutathione S-transferase domain protein  34.34 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  26.98 
 
 
310 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  32.22 
 
 
260 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  29.59 
 
 
264 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  26.78 
 
 
217 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  30.56 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  38.24 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  28.85 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  30.91 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  27.92 
 
 
313 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  27.97 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.09 
 
 
207 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  32.26 
 
 
241 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  30.77 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  36.14 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  34.07 
 
 
205 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  26.57 
 
 
203 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5691  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.65 
 
 
220 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  34.07 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.11 
 
 
205 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  31.03 
 
 
208 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  34.07 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  27.6 
 
 
214 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4529  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.95 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0927  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.95 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  37.36 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2422  glutathione S-transferase-like protein  34.07 
 
 
210 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0594947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  27.15 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  28.66 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  30.68 
 
 
205 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.26 
 
 
252 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1320  stringent starvation protein A  32.95 
 
 
207 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264365  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  28.18 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  30.77 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  32.63 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  28.03 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  28.87 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.92 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.92 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.67 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  31.87 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  27.92 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.92 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>