290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4076 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4076  MaoC-like dehydratase  100 
 
 		 137 aa  280  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.354915 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3812  MaoC-like dehydratase  87.59 
 
 		 140 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0106778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3724  MaoC domain protein dehydratase  83.94 
 
 		 141 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4069  dehydratase  54.74 
 
 		 141 aa  153  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1608  dehydratase  55.47 
 
 		 141 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0157  dehydratase  52.59 
 
 		 137 aa  146  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2527  MaoC-like dehydratase  51.56 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5770  MaoC domain protein dehydratase  53.17 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4755  MaoC-like dehydratase  52.31 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2727  putative MaoC-like dehydratase  48.44 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3988  dehydratase  47.79 
 
 		 136 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4169  MaoC-like dehydratase  50 
 
 		 138 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2940  dehydratase  51.97 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5027  putative acyl dehydratase  50 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000226168  normal  0.281597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1510  dehydratase  50 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1539  MaoC-like dehydratase  50 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.645367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1562  dehydratase  50 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0664  MaoC domain-containing protein  48.06 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0447  dehydratase  48.41 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3222  dehydratase  38.46 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.986163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3211  MaoC-like dehydratase  38.46 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3273  dehydratase  38.46 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0391  dehydratase  36.59 
 
 		 322 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2497  MaoC domain protein dehydratase  30.15 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4037  MaoC-like dehydratase  35.77 
 
 		 326 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.257252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4038  dehydratase  31.82 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0161  MaoC domain protein dehydratase  32.23 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.49242  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4180  MaoC domain protein dehydratase  34.88 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4153  MaoC domain protein dehydratase  34.88 
 
 		 332 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0742  MaoC-like dehydratase  35.82 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0921523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1777  MaoC domain protein dehydratase  27.94 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17510  acyl dehydratase  36 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.736026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21180  acyl dehydratase  44.19 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10649  (3R)-hydroxyacyl-ACP dehydratase subunit HadB  33.09 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0228319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2738  MaoC domain protein dehydratase  35.97 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00396042 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5103  MaoC domain protein dehydratase  41.41 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300678  normal  0.830614 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3026  dehydratase  35.94 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6065  dehydratase  32.59 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0358  MaoC domain-containing protein dehydratase  35.07 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.717661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21390  acyl dehydratase  39.62 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0000515647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4362  MaoC domain protein dehydratase  33.61 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0665  MaoC domain protein dehydratase  44 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0187656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0671  dehydratase  35.92 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0318034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0899  MaoC domain protein dehydratase  35 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344654  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5844  dehydratase  39.45 
 
 		 343 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5703  dehydratase  42.22 
 
 		 343 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5324  MaoC-like dehydratase  42.22 
 
 		 343 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5413  dehydratase  42.22 
 
 		 343 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4529  MaoC domain protein dehydratase  34.93 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2329  MaoC domain protein dehydratase  34.85 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.676407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2692  MaoC domain protein dehydratase  36.3 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0464  MaoC domain protein dehydratase  38.24 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.919633  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03560  acyl dehydratase  35.34 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2338  MaoC domain protein dehydratase  32.23 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_463  acyl dehydratase  31.09 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3411  MaoC domain protein dehydratase  31.93 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0289  dehydratase  35.77 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07690  acyl dehydratase  41.38 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.961228  normal  0.0437858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2665  hypothetical protein  31.69 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0498  dehydratase  29.51 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.14206  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0522  hypothetical protein  31.09 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000722837  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0994  dehydratase  40.78 
 
 		 343 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2677  dehydratase  31.53 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0345161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6364  MaoC domain-containing protein dehydratase  38.46 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1221  MaoC domain protein dehydratase  32.28 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0600  MaoC domain protein dehydratase  46.25 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.552837  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3182  MaoC domain protein dehydratase  43.06 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0456076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0206  dehydratase  27.97 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1674  MaoC domain-containing protein dehydratase  36.15 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0430305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2841  MaoC domain protein dehydratase  31.19 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3994  MaoC-like dehydratase  30.08 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1059  dehydratase  32.33 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0739  MaoC domain protein dehydratase  33.08 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0565  MaoC-like dehydratase  30.6 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1998  MaoC-like dehydratase  32.2 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3940  dehydratase  34.02 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2872  MaoC domain protein dehydratase  32.84 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0193  dehydratase  32.26 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21310  hypothetical protein  29.91 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2686  MaoC-like dehydratase  34.21 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2779  MaoC domain protein dehydratase  34.21 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.072272  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4552  MaoC domain protein dehydratase  28.12 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1337  dehydratase  28.12 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.282303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0370  MaoC domain protein dehydratase  30.08 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.758804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1822  hypothetical protein  29.91 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4827  MaoC domain protein dehydratase  36.49 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2748  MaoC domain protein dehydratase  30.15 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1800  3-alpha,7-alpha, 12-alpha-trihydroxy-5-beta-cholest-24-enoyl-CoAhydratase  42.86 
 
 		 282 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4332  dehydratase  32.99 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3568  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  32.46 
 
 		 500 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6646  MaoC domain protein dehydratase  35.11 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4059  dehydratase  27.34 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0115  MaoC domain protein dehydratase  31.82 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.527256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3031  bifunctional enoyl-CoA hydratase/phosphate acetyltransferase  35.71 
 
 		 471 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30160  3-Re enoyl-CoA hydratase PhaJ  27.34 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2677  dehydratase  36.36 
 
 		 276 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.211797  normal  0.0433405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4051  dehydratase  29.06 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4356  MaoC-like dehydratase  29.82 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3847  dehydratase  26.24 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1010  MaoC domain protein dehydratase  33.87 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>