More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4001 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4001  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  100 
 
 		 332 aa  672    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  hitchhiker  0.00239808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1710  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  93.98 
 
 		 332 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3756  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  93.37 
 
 		 332 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1293  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  90.94 
 
 		 331 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2818  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  88.54 
 
 		 334 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.292291  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6437  bacteriochlorophyllide reductase subunit  83.13 
 
 		 332 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2957  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  86.21 
 
 		 334 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562644  normal  0.106043 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2730  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  86.21 
 
 		 334 aa  521  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2852  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  86.48 
 
 		 334 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.467181 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2052  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  85.43 
 
 		 329 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0401365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2980  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  80.69 
 
 		 322 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.551452  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0262  chlorophyllide reductase, BchX subunit  78.01 
 
 		 333 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1906  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.01 
 
 		 333 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.195312  normal  0.342059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0179  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.31 
 
 		 332 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1610  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.27 
 
 		 308 aa  484  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2036  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  76.81 
 
 		 333 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128879  normal  0.148477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3517  bacteriachlorophyllide reductase iron protein subunit X  78.7 
 
 		 335 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3697  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  82.02 
 
 		 334 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.326081  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3746  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.62 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0605815  hitchhiker  0.0000012212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3260  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.62 
 
 		 392 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257772 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3127  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  42.41 
 
 		 411 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1792  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  46.6 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.344281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0979  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  43.81 
 
 		 370 aa  235  8e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0400  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.2 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0534457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0937  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.42 
 
 		 372 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0897  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.7 
 
 		 365 aa  233  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1423  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  49.19 
 
 		 366 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1535  chlorophyllide reductase iron protein subunit X  45.67 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.292172  normal  0.0217876 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1573  nitrogenase iron protein subunit NifH  37.92 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1023  nitrogenase iron protein  40.53 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1158  nitrogenase reductase  38.69 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1815  Nitrogenase  43.9 
 
 		 251 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1142  nitrogenase iron protein  38.2 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.442855  normal  0.809863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0561  nitrogenase iron protein  37.64 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000368653  normal  0.199489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2821  nitrogenase iron protein  39.69 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0171  nitrogenase reductase  39.54 
 
 		 273 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.217628  normal  0.670038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1751  nitrogenase reductase  41.41 
 
 		 274 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.555016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0506  nitrogenase reductase-like protein  36.23 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1019  nitrogenase reductase  38.15 
 
 		 274 aa  165  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855562  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0834  nitrogenase reductase  38.78 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1627  nitrogenase reductase  41.41 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000481616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0237  Nitrogenase  39.16 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.848648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0404  NifH/frxC-family protein  39.85 
 
 		 731 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.394931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0491  nitrogenase iron protein  37.69 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2098  nitrogenase iron protein  36.26 
 
 		 292 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1202  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.15 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451718  hitchhiker  0.00669218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4043  nitrogenase iron protein  37.04 
 
 		 273 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0162942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1201  nitrogenase iron protein  35.82 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01380  Nitrogenase iron protein  37.55 
 
 		 290 aa  159  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0793  nitrogenase  38.69 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00476725  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1353  nitrogenase iron protein  36.64 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3030  nitrogenase iron protein  36.09 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3090  nitrogenase reductase  37.13 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0274  nitrogenase iron protein  37.69 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23577  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0095  Nitrogenase  45.45 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1147  nitrogenase reductase-like protein  36.33 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2083  nitrogenase  38.52 
 
 		 270 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1224  nitrogenase reductase-like protein  34.87 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49000  nitrogenase reductase  36.7 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1528  nitrogenase reductase  39.38 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0685  nitrogenase reductase  39.38 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0744  nitrogenase reductase  38.94 
 
 		 274 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0143  nitrogenase iron protein  35.93 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.343179  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2281  nitrogenase reductase  37.04 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000562599  normal  0.173141 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2613  nitrogenase reductase  37.5 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0088  nitrogenase reductase  37.28 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.55556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1244  nitrogenase reductase  39.82 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000240583  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2610  nitrogenase reductase  36.19 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.343866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1949  nitrogenase reductase  37.74 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00645764  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2008  nitrogenase iron protein  35.74 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.221735  normal  0.365396 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1049  nitrogenase iron protein  38.25 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0143  nitrogenase reductase  37.69 
 
 		 293 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1623  nitrogenase reductase  36.57 
 
 		 275 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1528  nitrogenase reductase-like protein  34.9 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0803  nitrogenase reductase-like protein  35.61 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.186385  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1395  nitrogenase reductase  36.47 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3916  nitrogenase reductase  33.91 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2597  nitrogenase iron protein  35.45 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.036256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2886  Nitrogenase  36.3 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2907  nitrogenase iron protein  34.57 
 
 		 289 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0229  nitrogenase reductase  36.3 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1415  nitrogenase iron protein subunit NifH  39.01 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.210537 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1041  nitrogenase iron protein subunit NifH  38.31 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.343788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3632  nitrogenase reductase  38.1 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.664822 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3203  nitrogenase iron protein  36.8 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4488  nitrogenase iron protein subunit NifH  35.56 
 
 		 287 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3771  nitrogenase iron protein  35.69 
 
 		 299 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0377842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0098  nitrogenase reductase  36.46 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.380897  normal  0.0345089 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4684  nitrogenase reductase  35.58 
 
 		 275 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1152  nitrogenase reductase-like protein  35.58 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1733  protochlorophyllide reductase iron-sulfur ATP-binding protein  37.23 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4046  nitrogenase iron protein  35.61 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.316801  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1465  nitrogenase reductase  37 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375574  hitchhiker  0.00132251 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1354  nitrogenase iron protein  33.56 
 
 		 296 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0774  nitrogenase  35.85 
 
 		 290 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4478  nitrogenase reductase  34.59 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3467  nitrogenase iron protein  36.09 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0795  nitrogenase iron protein  34.94 
 
 		 291 aa  149  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.835028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3996  nitrogenase reductase  37.17 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6881  nitrogenase iron protein  34.44 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>