More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3804 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3804  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.305091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4442  Nucleotidyl transferase  79.94 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  51.97 
 
 		 240 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  46.05 
 
 		 234 aa  229  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  42.62 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14401  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.47 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00981  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.05 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3884  nucleotidyl transferase  38.89 
 
 		 240 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.883067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.76 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 841 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  28.63 
 
 		 828 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  31.62 
 
 		 833 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  32.48 
 
 		 843 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  28.52 
 
 		 329 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3313  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.618887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  26.5 
 
 		 827 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.91 
 
 		 828 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  29.8 
 
 		 835 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 810 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  26.94 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  30.77 
 
 		 832 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.72 
 
 		 854 aa  99.4  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  28.09 
 
 		 830 aa  99  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  30.4 
 
 		 363 aa  99  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.89 
 
 		 364 aa  99  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 712 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 834 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  25.75 
 
 		 784 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.36 
 
 		 837 aa  97.4  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  26.87 
 
 		 835 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  25.75 
 
 		 784 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  29.36 
 
 		 832 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  25.75 
 
 		 784 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  31.2 
 
 		 357 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.77 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 		 832 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  30.34 
 
 		 367 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  27.82 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  30.83 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  25.42 
 
 		 820 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  27.69 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  29.57 
 
 		 827 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25.32 
 
 		 784 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.32 
 
 		 784 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.32 
 
 		 784 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  25.32 
 
 		 784 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  25.32 
 
 		 784 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  30.87 
 
 		 828 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  31.8 
 
 		 364 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.83 
 
 		 392 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.83 
 
 		 392 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  24.07 
 
 		 785 aa  92.8  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  25.32 
 
 		 784 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  34.21 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 245 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3113  Nucleotidyl transferase  29.31 
 
 		 231 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.91659  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  25.32 
 
 		 784 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  29.24 
 
 		 833 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  27.66 
 
 		 843 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  26.43 
 
 		 835 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  28.67 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 392 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  27.8 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  28.92 
 
 		 359 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  28.63 
 
 		 821 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  26.5 
 
 		 835 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.36 
 
 		 392 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 392 aa  90.1  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  24.46 
 
 		 776 aa  89.7  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.36 
 
 		 392 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  28.21 
 
 		 392 aa  90.1  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  26.91 
 
 		 818 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  30.21 
 
 		 346 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  24.36 
 
 		 820 aa  89.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  25.2 
 
 		 836 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  26.79 
 
 		 830 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  27.95 
 
 		 370 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  31.02 
 
 		 399 aa  88.6  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  25.71 
 
 		 816 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  25.21 
 
 		 836 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 828 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  29.56 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2356  Nucleotidyl transferase  30.09 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  28.12 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  27.39 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  28.12 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  28.12 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  26.81 
 
 		 842 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  30.65 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  25.21 
 
 		 836 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  25.21 
 
 		 836 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  31.35 
 
 		 238 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  27.07 
 
 		 370 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  25.36 
 
 		 370 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  29.07 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.4 
 
 		 355 aa  86.7  5e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>