60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3146 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3146  NosL  100 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0432  NosL  75.69 
 
 		 181 aa  253  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2355  NosL family protein  77.33 
 
 		 183 aa  237  8e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6012  nitrous oxide reductase accessory protein NosL (required for nitrous oxide reduction)  59.63 
 
 		 181 aa  201  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58759  normal  0.13481 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0255  putative protein disulfide isomerase NosL  56.97 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0279  protein disulfide isomerase NosL, putative  56.36 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4342  NosL family protein  54.4 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  54.43 
 
 		 193 aa  187  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4215  NosL family protein  51.33 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00664819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3325  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.116976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3198  nitrous oxide reductase accessory protein NosL  46.79 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  41.32 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3404  NosL family protein  42.74 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  35.67 
 
 		 196 aa  94.7  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  33.33 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  36.77 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  36.77 
 
 		 182 aa  91.3  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  40.16 
 
 		 163 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  40.16 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  34.69 
 
 		 171 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  36.88 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  41.88 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1424  protein disulfide isomerase NosL family protein  32.45 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.713871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  39.37 
 
 		 163 aa  89  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1394  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  35.71 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4450  NosL family protein  34.42 
 
 		 162 aa  87.8  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1373  NosL lipoprotein  35.29 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0499  NosL protein  34.55 
 
 		 162 aa  84.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4912  putative nosL lipoprotein  36.84 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372071  decreased coverage  0.000372445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  37.8 
 
 		 163 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  29.63 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1478  NosL family protein  37.67 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2064  putative protein disulfide isomerase NosL  36.69 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2119  putative protein disulfide isomerase NosL  36.69 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2259  hypothetical protein  36.69 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0991  protein disulfide isomerase NosL, putative  36.69 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1078  NosL family protein  30.94 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0485  nosL protein  40.16 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0488  NosL family protein  37.19 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0485  NosL family protein  31.82 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.818719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0509  NosL family protein  37.29 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20150  NosL protein  37.06 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4176  NosL family protein  35.83 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4064  NosL family protein  35.83 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  32.14 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3871  NosL family protein  39.37 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3206  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  43.53 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2321  protein disulfide isomerase NosL, putative  37.59 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4471  NosL family protein  37.29 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1734  NosL protein  36.36 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.279762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  31.29 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  29.25 
 
 		 350 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  31.97 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2680  lipoprotein NosL  23.16 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  31.08 
 
 		 918 aa  45.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  28.33 
 
 		 364 aa  44.3  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  28.48 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1721  NosL family protein  28.99 
 
 		 189 aa  42  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0249682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0794  NosL family protein  26.67 
 
 		 205 aa  42  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  32.52 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>