33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4334 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  744    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  86 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  48.08 
 
 		 347 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  60.53 
 
 		 278 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  60.09 
 
 		 329 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  60.53 
 
 		 279 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  59.21 
 
 		 305 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49380  hypothetical protein  49.59 
 
 		 165 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  32.75 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  29.64 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  30.32 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  34.88 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  26.18 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.7 
 
 		 3242 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  39.47 
 
 		 356 aa  49.7  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  38.96 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  27.71 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4625  hypothetical protein  48.89 
 
 		 165 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  19.62 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  19.62 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0743  sensor histidine kinase  19.62 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  19.62 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  19.62 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  19.62 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  19.62 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  23.21 
 
 		 626 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2616  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1243 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99853  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  28.89 
 
 		 257 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  24.78 
 
 		 1196 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 		 1216 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  36.96 
 
 		 268 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  28.57 
 
 		 3392 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44406  predicted protein  27.55 
 
 		 1782 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0950443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>