14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0627 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  100 
 
 		 382 aa  772    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  38.27 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  45.21 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  31.71 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  30.65 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  32.14 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  31.94 
 
 		 245 aa  46.6  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  24.16 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  30.95 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  27.71 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2832  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>