15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4775 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  97.05 
 
 		 305 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  94.6 
 
 		 278 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  78.49 
 
 		 279 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  62.88 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  60.96 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  60.96 
 
 		 347 aa  271  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49380  hypothetical protein  63.03 
 
 		 165 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  35.39 
 
 		 224 aa  90.5  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  38.46 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  38.46 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  37.65 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  32.56 
 
 		 265 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  27.08 
 
 		 382 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  36.11 
 
 		 268 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>