23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4791 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  95.3 
 
 		 388 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  63.98 
 
 		 347 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  62.95 
 
 		 278 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  62.56 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  61.67 
 
 		 279 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  61.61 
 
 		 305 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49380  hypothetical protein  52.5 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  32.75 
 
 		 224 aa  86.3  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  30.04 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  30.6 
 
 		 302 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  36.05 
 
 		 265 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  37.66 
 
 		 356 aa  50.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  23.65 
 
 		 317 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4625  hypothetical protein  48.89 
 
 		 165 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145619  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  27.36 
 
 		 3242 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  24.14 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  37.66 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  28.89 
 
 		 257 aa  44.3  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3835  hypothetical protein  52.27 
 
 		 160 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2670  prophage LambdaMc01, tail tape measure protein, putative  22.22 
 
 		 1343 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  27.36 
 
 		 1660 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.58 
 
 		 1356 aa  43.1  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>