18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3130 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  478  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  44.17 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2207  hypothetical protein  31.84 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  44.32 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  29.58 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  31.28 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  34.52 
 
 		 119 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  32.53 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  37.65 
 
 		 329 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  37.65 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  35.45 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  38.96 
 
 		 388 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  37.33 
 
 		 356 aa  48.5  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  37.66 
 
 		 443 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  30.97 
 
 		 382 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  32.95 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  36.67 
 
 		 347 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2832  hypothetical protein  38.46 
 
 		 129 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>