17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0409 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  100 
 
 		 356 aa  710    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  33.6 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  42.05 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  42.05 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  42.53 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2207  hypothetical protein  30.38 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  39.53 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  38.82 
 
 		 119 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  33.33 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  35.48 
 
 		 268 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  37.33 
 
 		 245 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  37.66 
 
 		 443 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  39.47 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0586  hypothetical protein  52.38 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.777226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2832  hypothetical protein  38.16 
 
 		 129 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  34.83 
 
 		 257 aa  43.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>