15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1451 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  534  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  41.88 
 
 
245 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  31.75 
 
 
224 aa  58.9  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  32.63 
 
 
119 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  32.37 
 
 
317 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  36.52 
 
 
356 aa  55.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  30.11 
 
 
265 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2832  hypothetical protein  35.85 
 
 
129 aa  48.9  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  34.02 
 
 
313 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  34.02 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  25.32 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  33.09 
 
 
443 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  33.81 
 
 
388 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  26.05 
 
 
382 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  41.89 
 
 
347 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>