20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2125 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  619  1e-176  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  96.17 
 
 
302 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  36.23 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  29.27 
 
 
356 aa  84  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  38.36 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  36.99 
 
 
329 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  37.5 
 
 
305 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  31.58 
 
 
119 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  32.79 
 
 
882 aa  49.7  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  34.41 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  34.21 
 
 
347 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  30.95 
 
 
581 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  30.95 
 
 
581 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  28.03 
 
 
1056 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  37.31 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2207  hypothetical protein  33.7 
 
 
350 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395181  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  31.67 
 
 
224 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  33.8 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1484  hypothetical protein  28.28 
 
 
201 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>