22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2172 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  96.17 
 
 
313 aa  501  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  36.98 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  35.57 
 
 
265 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  28.86 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0645  hypothetical protein  38.36 
 
 
279 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  36.99 
 
 
329 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4829  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4651  hypothetical protein  37.5 
 
 
305 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.277602 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  31.58 
 
 
119 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  34.41 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4938  hypothetical protein  34.21 
 
 
347 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.853403  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4791  hypothetical protein  37.31 
 
 
443 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2207  hypothetical protein  33.7 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  37.31 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0155  hypothetical protein  51.85 
 
 
424 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694337  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1484  hypothetical protein  28.28 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4021  hypothetical protein  31.67 
 
 
224 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal  0.145684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1876  ribonuclease  27.48 
 
 
1056 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.166122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  33.8 
 
 
257 aa  43.5  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1469  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  31.4 
 
 
882 aa  42.7  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>